GraphingエージェントをBioRender Graphingで使用する方法

BioRenderのGraphingエージェントは、グラフの作成と分析を支援する組み込みアシスタントです。手動で設定する代わりに、調べたい内容を自然な言葉で説明すると、Graphingエージェントが生データから直接グラフを作成します。Graphingエージェントは現在ベータ版であることにご注意ください。 

Graphingエージェントを試す

この記事では、以下について説明します。

• Graphingエージェントを使用できるユーザー
• エージェントでできること、まだできないこと
• 仕組み
• データとプライバシー
• エージェントを使ってグラフを作成、分析を実行、グラフを編集する方法
• 必要な結果を得るためのヒント
• よくある質問への回答

Graphingエージェントを使用できるユーザー

GraphingエージェントはBioRender Graphingの一部で、追加料金なしで利用できます。まだGraphingシートをお持ちでない場合は、BioRender Graphing：プランと料金をご覧ください。

Graphingエージェントでできること

• データを追加する：スプレッドシートのアップロードを案内し、ファイル内のデータセットを見つけ、変数を検出します。
• データを説明する：インポート後、細胞株全体の濃度測定値を含むELISAプレートデータセットなど、データセットの内容を説明します。
• グラフを提案して作成する：データに適したグラフの種類を推奨し、変数を割り当て、グループ化のオプションを提示して、グラフを作成します。
• 分析をRunする：グラフで利用可能な分析を一覧表示し、1つを推奨して設定を支援します。
• グラフをカスタマイズする：色、ラベル、軸、データポイントのスタイルなど、変更内容を説明すると、エージェントが適用します。
• 次のステップを提案する：各ステップの後に、細胞株を比較するために分析を適合させるなど、次に行うことを提案します。
• タブ間で継続して利用する：エージェントは「データ」、「Graph」、「分析」タブで利用でき、タブを切り替えても会話とデータのコンテキストが維持されます。

エージェントでまだできないこと

• BioRender Graphingでまだ提供されていないグラフの種類を作成したり、分析を実行したりすることはできません。
• グラフ要素をクリックしてチャットに送信することはできません。代わりに、変更したい内容を説明してください。

仕組み

• 対応しているグラフと分析のみ：エージェントは利用可能なグラフと分析にのみ対応します。
• BioRender独自の方法：エージェントは、テスト済みのBioRender独自の分析方法を使用します。これは、「新しい分析を実行」をクリックしたときに利用できるものと同じです。
• 不明な場合は確認します：どの変数またはグループを指しているのか判断できない場合は、質問します。
• できないことを知らせます：リクエストに対応していない場合や失敗した場合、エージェントはできなかった内容を説明します。

データとプライバシー

Graphingのエージェント機能を使用する場合、データはBioRenderによって安全に保護されます。エージェントはBioRenderに組み込まれた分析およびグラフ作成ツールを通じて動作するため、データを読み取ったり変更したりすることはなく、同意なしにAIのトレーニングに使用することもありません。

エージェントの場所

エージェントは「BioRenderに質問」チャットボックスです。新しいGraphingファイルを初めて作成すると表示され、「データ」、「Graph」、「分析」のすべてのタブに表示されます。

• 新しい空のファイルの場合：「データ」タブの中央に開き、挨拶が表示されます。
• 「データ」、「Graph」、「分析」ページの場合：画面下部中央に表示されます。「BioRenderに質問」をクリックすると会話が開きます。

例：「データ」タブのGraphingエージェント。

例：「Graph」タブのGraphingエージェント（サイドパネルのオプションを開いて別の表示にすると、エージェントの表示方法を変更できます）。

エージェントでグラフを作成する

ステップ1：データを追加する

1. Galleryから、「新規作成」 > 「Graph」 > 「Graphing」をクリックします。
2. メッセージ内の「データをアップロード」をクリックするか、チャットボックスの「+」ボタンをクリックします。
3. ファイルを選択します。対応形式：.csv、.xls、.xlsx、.prism、.pzfx（最大50MB）。
4. 「ファイルからデータセットを選択」ウィンドウで、使用するデータセットを選択するか、「すべて選択」を選択してから、「データをインポート」をクリックします。
5. エージェントが追加した内容を確認し、検出した内容を説明します。検出した変数が強調表示されます。

💡「データをアップロード」または「+」ボタンを使用すると、いつでもデータセットをアップロードできます。どちらも同じインポートウィンドウを開きます。

例：Upload dataset。

別の方法で開始したい場合は、「Blank spreadsheet」をクリックして独自のデータを貼り付けたり入力したり、「サンプルデータセットを試す」をクリックしてサンプルデータを確認したりすることもできます。詳しくは、BioRender Graphingでデータを追加する方法をご覧ください。

💡GraphPad Prismからインポートしていますか？PrismファイルをBioRender Graphingにインポートする方法をご覧ください。 

ステップ2：グラフを作成する

1. チャットでグラフを依頼します。例：「[データセット名]からグラフを設定するのを手伝ってください。」エージェントでデータをインポートした場合は、グラフの種類を推奨します。
2. エージェントが、用量反応曲線など、データに適したグラフの種類を提案します。承認するか、別のグラフの種類を伝えます。
3. エージェントが、数値のX軸や数値のY軸など、そのグラフに必要な要素を説明し、変数を割り当てます。
4. グラフがグループ化に対応している場合、エージェントがオプションを提示します。オプションをクリックするか、独自の内容を入力します。
5. エージェントがグラフの概要をまとめたプランを表示します。「グラフを作成」をクリックします。
6. エージェントが作成内容を確認し、新しいグラフにすぐ移動します。 

例：グラフの種類を提案するグラフ作成エージェント。

ステップ3：分析をRunする

1. チャットに「分析を実行」と入力するか、実行したい分析名を入力します。グラフの作成後にエージェントが分析を提案することもあります。
2. エージェントが、グラフの種類で利用可能な分析を一覧表示します。用量反応曲線の場合は次のとおりです。

• Outlier Detection：データ内の外れ値にフラグを付けます
• Area Under Curve：各グループの曲線下の総面積
• 相関分析：2つの数値変数間の関連の強さと方向
• 線形回帰：線形関係をモデル化します
• 非線形回帰：dose-responseモデルなどの曲線を適合させます

3. エージェントがデータに適した分析を推奨します。提案をクリックするか、使用したい分析を入力します。
4. エージェントの指示に従って分析を設定します。
5. 「分析」タブで結果を確認します。有意な比較がグラフに追加されます。

例：グラフ作成エージェントは、グラフの種類に応じて利用可能な分析を提案します。 

分析について詳しくは、BioRender Graphingで統計分析を実行するをご覧ください。

ステップ4：グラフをカスタマイズする

1. Graphページで、「BioRenderに質問」をクリックします。
2. 変更したい内容を説明します。グループ、軸、凡例など、グラフの対象部分を指定します。
3. 更新されたグラフを確認します。
4. 結果が気に入らない場合は、左上隅の元に戻す矢印をクリックするか、エージェントに操作の取り消しまたは元に戻すよう依頼します。 

エージェントはBioRender内の同じGraphingツールを使って変更を行うため、グラフは手動で完全に編集できます。

例：プロンプト：「X軸上で9.899～103.1の間にあるCompound Bのデータポイントを赤にする」。中央のチャットビューでエージェントを操作しています。

カスタマイズ方法の詳細については、グラフをカスタマイズする方法をご覧ください。

入力例

より良い結果を得るためのヒント

• 具体的に指示する：何をどこで変更したいかを伝えます。「色を変更して」ではなく、「Treatment 1だけを赤にして、それ以外のすべてのデータ系列をグレースケールにして」と入力してみてください。
• データ名を指定する：「細胞株でグループ化」のように、データセット名、変数名、グループ名を使用します。
• 一度に1つの変更を行う：結果を確認して元に戻しやすくなります。
• 提案ボタンを使用する：エージェントがオプションを提示した場合は、入力する代わりに1つをクリックします。
• 意図と異なる場合は言い換える：結果が望んだものではない場合は、元に戻して別の言葉で変更内容を説明します。

いつでも手動で操作する

いつでもエージェントとのチャットと手動操作を切り替えられます。

• グラフをカスタマイズする：「Graph」タブの右上にある「グラフをカスタマイズ」をクリックして、手動で編集します。
• Graphの詳細：「Graphの詳細」パネルで「Edit」をクリックし、データセット、変数、グループ化を変更します。
• 新しい分析をRunする：「分析」パネルで「新しい分析をRun」をクリックします。
• 元に戻す／やり直す：左上隅の矢印を使用します。

トラブルシューティング

「BioRenderに質問」ボックスが表示されません。 

ページを更新してから、Graphingファイルを開いていることを確認してください。それでも表示されない場合は、サポートにお問い合わせください。

エージェントが依頼したとおりに実行しませんでした。 

変更を元に戻してから、より具体的なリクエストでもう一度試してください。対象のグループ、軸、データポイントを指定します。エージェントがリクエストされた操作を実行できない場合は、その理由を説明します。

エージェントが希望していないグラフをsuggestedしました。 

希望するグラフの種類を伝えるか、「データ」タブのグラフパネルから自分で選択してください。

「新しい分析をRun」が応答しません。 

まずグラフの詳細を確認または保存する必要があります。「Graphの詳細」パネルが編集モードのまま開いていないか確認し、閉じるか確定してください。

ファイルをインポートできませんでした。 

ファイルが対応形式で、50MB未満であることを確認してください。データの制限については、BioRender Graphingでデータを追加する方法をご覧ください。

よくある質問

エージェントを使用するにはGraphingシートが必要ですか？ 

エージェントはBioRender Graphingの一部です。 

エージェントは追加料金がかかりますか？ 

いいえ。追加料金はかかりません。 

エージェントはデータを変更しますか？

いいえ。グラフをカスタマイズしても、変更されるのは見た目だけです。基になるデータは変わりません。

エージェントは私のデータをAIモデルのトレーニングに使用しますか？

Graphingのエージェント機能を使用する場合、データはBioRenderによって安全に保護されます。エージェントはBioRenderに組み込まれた分析およびグラフ作成ツールを通じて動作するため、データを読み取ったり変更したりすることはなく、同意なしにAIのトレーニングに使用することもありません。

変更を元に戻すにはどうすればよいですか？ 

左上隅の元に戻す矢印をクリックするか、Graphingエージェントに操作を元に戻すよう依頼します。やり直す矢印を使用すると、変更を再適用できます。

エージェントで任意の分析を実行できますか？ 

エージェントは、グラフの種類で利用可能な分析を提示します。

Graphingエージェントなしでもグラフを作成できますか？ 

はい。「データ」タブの「グラフ」パネルからグラフの種類を選択し、変数を割り当てて、「Continue」をクリックします。BioRender Graphingを始めるをご覧ください。