BioRender Graphingで統計解析を実行する

BioRender Graphingには、実験データを自信を持って解釈するための、包括的な統計解析ツールが用意されています。 

どの検定を実行すればよいかわからない場合でも安心してください。Graphingの解析ガイダンスでは、データに基づいて最適な検定を推奨します。バックグラウンドで正規性と等分散性のチェックを実行するため、自分で調べたり専門家に尋ねたりする必要はありません。別の検定を選択した場合は、BioRenderがそのトレードオフを説明するため、毎回一貫した解析を実行できます。

📌 ベータ版： Graphingエージェントは現在ベータ版です。

この記事では、次の方法について説明します：

• Graphingエージェントに解析を実行するよう依頼する
• Graphingの解析ガイダンスを適用して適切な検定を選択する - 組み込みの事前検定でデータを評価し、最適な解析とその理由を平易な言葉で説明する
• 外れ値を自動的に検出して削除する - 外れ値にはすぐにフラグが付けられるため、影響をプレビューし、ワンクリックで除外できます
• Run統計解析 - t-tests、ANOVAs、回帰など
• グラフを並べて比較する - 1か所で複数の解析を確認し、パターンをすばやく見つける

解析ガイダンスの詳細

BioRenderがデータに適した検定を推奨する方法をご覧ください：

→ 統計解析：利用可能な検定と実行方法

外れ値の検出

外れ値の検出に関する詳細記事では、検出の仕組みと結果の操作方法について、次の内容を含めて説明しています：

• ROUT法の仕組みと、単純な検定よりも複数の外れ値を適切に処理できる理由
• 外れ値の結果を解釈する方法
• 感度を調整する方法、またはデータポイントを除外する方法
• 要件と制限（グループあたり最低4件の観測値、最大28グループ）

→ BioRender Graphingでの外れ値の検出

Graphingエージェントで解析をRunする

1. チャットで「run an analysis」と入力するか、実行したい解析の名前を入力します。 
2. エージェントがグラフの種類で利用可能な解析を一覧表示し、その中から1つを推奨します。たとえば、EC50/IC50フィッティングでは、非線形回帰を推奨する場合があります。 
3. 候補をクリックするか、希望する解析を入力します。エージェントの指示に従って解析を設定します。  
4. 解析タブで結果を確認します。
5. 結果が予想と異なる場合は、「Undo」をクリックしてワンクリックで解析を元に戻すか、エージェントに操作を元に戻すよう依頼します。その後、もう一度試してください。エージェントが実行できない操作については、完了できなかった内容を知らせます。

注：エージェントが実行するのは、Graphingでサポートされている解析のみです。BioRender独自の解析手法を使用しており、「Run new analysis」の背後で使用されているものと同じです。 

エージェントは既存の解析ツール上で実行されるため、以下で説明する推奨検定バッジ、事前検定、警告を同じように利用できます。信頼性が検証済みのシステムによるすべてのメリットに加え、エージェントがワークフローを進め、解析やグラフ作成を支援します。

エージェントの詳細については、BioRender GraphingでBioRender AIエージェントを使用する方法（ベータ版）をご覧ください。

すべて自分で設定したい場合は、以下の手順を使用してください。

統計解析を手動で実行する方法

1. Graph編集ページで、「+ Run new analysis」をクリックします
2. 3つのセクションで構成されたフォームが表示されます：

セクション1

可能な場合、BioRender Graphingの解析ガイダンスが、データに基づいて最適な統計検定を自動的に推奨します。推奨された検定にはバッジが表示されます。

• ドロップダウンを開いて利用可能なすべてのオプションを表示し、推奨を上書きできます。
• データの前提条件に合わない検定を選択した場合（例：データが正規分布ではないのにパラメトリック検定を選択した場合）、推奨された検定が依然として望ましい理由を説明するメモが表示されます。
• データが要件を満たしていない場合、一部の検定がグレー表示されることがあります。理由を確認するには、ツールチップをご覧ください。

カテゴリグループを選択

• デフォルトでは、グラフのすべてのグループが含まれます。
• この解析に含めないグループの選択を解除します。 

例（用量反応曲線に基づく） 

セクション2 - 解析を微調整する

このセクションでは、解析の統計設定を調整できます。利用可能なオプションは、選択した解析の種類によって異なる場合があります。BioRenderは、データに対して実行された事前検定に基づいて設定を推奨しますが、必要に応じて変更できます。

• データ設定 - 解析用のデータの整理方法を定義します。利用可能なオプションは、選択した手法によって異なります。
• 詳細オプション - 利用可能な場合、このセクションを展開して追加の設定にアクセスします。
• 前提条件 - 一部の解析には、データに関する設定可能な前提条件が含まれています。該当する場合は、これらの設定を確認して調整できます。

例（用量反応曲線に基づく） 

セクション3 - Optionsと追加設定

一部の解析には、結果の比較方法や計算方法を調整できる追加オプションが含まれています。これらの設定は、選択した解析に関連する場合にのみ表示され、推奨オプションが自動的に適用されます。

• 比較
  該当する場合は、グループまたは条件の比較方法を選択します。すべてのグループを比較するか、特定の比較を選択できます。
• 事後検定
  一部の解析には、グループ間の差を詳しく調べるための任意の事後検定が含まれています。手法を選択するか、推奨オプションを使用できます。
• 自動推奨
  BioRenderは、解析の種類とデータに基づいて適切な設定を提案しますが、必要に応じて調整できます。

例（用量反応曲線に基づく） 

解析レポートを表示する 

解析の設定を確認したら、"Run analysis"をクリックして解析レポートを表示します。 

BioRender Graphing内の解析レポートで、解析を実行した日付とRのバージョンを確認できます。以下の例のスクリーンショットをご覧ください。

結果を表示する

解析が実行されると：

• 完全な結果テーブルと記述統計が解析タブに表示されます
• 有意な比較が有意差マーカーとともにグラフに自動的に追加されます
• 解析タブのチェックボックスを使用して、グラフに表示する結果を切り替えられます
• 同じグラフで複数の解析を実行し、表示する解析を制御できます

利用可能な解析の種類

さらに詳しく知りたいですか？次の記事では、解析の種類と、BioRenderのGraphingツールで統計解析を実行する方法について、次の内容を含めて説明します：

• t-tests
• 一元配置および二元配置ANOVAs
• 多重比較検定
• 線形回帰およびdose-response回帰
• Survival analysis、ロジスティックregression、相関

→ 統計解析：利用可能な検定と実行方法

Graph Gridビューでグラフを並べて比較する

ファイルが大きくなったら、Graph Gridビュー（Graphタブ）を使用して、ファイル内のすべてのグラフを一目で確認できます。

ビューを操作する

• 名前でグラフを検索する
• データセットでフィルタリングし、特定のデータテーブルのグラフに絞り込む
• 名前、作成日、または最終更新日でSort byする

注：Graph Gridビューに表示されるのは、現在のファイル内のグラフのみです。他のファイルのグラフはここには表示されません。

次のステップ

解析は完了しました。次は、プレゼンテーション用に仕上げましょう。BioRender Graphingでグラフをプレゼンテーションするに進み、次の方法を学びましょう：

• ライブ編集とStyle Matchを使ってグラフの外観を微調整する
• グラフをPowerPointまたはGoogle Slidesに直接挿入する
• データの変更に合わせて、ワンクリックでグラフを最新の状態に保つ

グラフをプレゼンテーションする →

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