BioRender Graphingで統計解析を実行する BioRender Graphingで統計解析を実行する

BioRender Graphingで統計解析を実行する

BioRender Graphingで統計解析を実行する

BioRender Graphingには、実験データを自信を持って解釈するための包括的な統計解析ツールが用意されています。 

どの検定を実行すればよいかわからない場合は、Graphingの解析ガイダンスが、データに基づいて最適な検定を推奨します。正常性および等分散性のチェックもバックグラウンドで実行されるため、自分で調べたり専門家に尋ねたりする必要はありません。別の検定を選択した場合は、BioRenderがそのトレードオフを説明するため、毎回一貫した解析を実行できます。

この記事では、次の方法を説明します。

  • Graphingの解析ガイダンスを適用して適切な検定を選択する - 組み込みの事前検定がデータを評価し、最適な解析を推奨するとともに、その理由をわかりやすい言葉で説明します
  • 外れ値を自動的に検出して削除する - 外れ値にはすぐにフラグが付くため、その影響をプレビューし、ワンクリックで除外できます
  • Run統計解析を実行する - t-tests、ANOVAs、回帰分析など
  • グラフを横並びで比較する - 1か所で複数の解析を確認し、パターンをすばやく見つけることができます

Learn more解析ガイダンスについて詳しく見る

BioRenderがデータに適した検定を推奨する方法をご覧ください。

→ 統計解析:利用可能な検定と実行方法

外れ値の検出

外れ値の検出に関する記事では、検出の仕組みと結果の操作方法について、次の内容を含めて詳しく説明しています。

  • ROUT法の仕組みと、単純な検定よりも複数の外れ値を適切に処理できる理由
  • 外れ値の結果を解釈する方法
  • 感度を調整する方法、またはデータポイントを除外する方法
  • 要件と制限(グループあたり最低4件の観測値、最大28グループ)

→ BioRender Graphingでの外れ値の検出

統計解析を実行する方法

  1. Graph編集ページで、+ Run new analysisをクリックします
  2. 3つのセクションで構成されたフォームが表示されます。

セクション1

可能な場合、BioRender Graphingの解析ガイダンスが、データに基づいて最適な統計検定を自動的に推奨します。推奨された検定にはバッジが表示されます。

  • ドロップダウンを開くと利用可能なすべてのオプションを確認でき、推奨を上書きできます。
  • データの前提条件に合わない検定を選択した場合(例:データが正規分布していないのにパラメトリック検定を選択した場合)、推奨された検定が依然として適している理由を説明するメモが表示されます。
  • データが要件を満たしていない場合、一部の検定がグレー表示されることがあります。理由を確認するには、ツールチップをご覧ください。

カテゴリグループを選択する

  • デフォルトでは、グラフのすべてのグループが含まれます。
  • この解析に含めないグループの選択を解除します。 

例(one-way ANOVAに基づく) 

セクション2 - 解析を微調整する

このセクションでは、解析の統計設定を調整できます。利用可能なオプションは、選択した解析の種類によって異なる場合があります。BioRenderは、データに対して実行された事前検定に基づいて設定を推奨しますが、必要に応じて変更できます。

  • データ設定 - 解析のためにデータをどのように整理するかを定義します。利用可能なオプションは、選択した方法によって異なります。
  • 詳細オプション - このセクションを展開すると、利用可能な場合に追加の構成設定にアクセスできます。
  • 前提条件 -  一部の解析には、データに関する設定可能な前提条件が含まれます。該当する場合は、これらの設定を確認して調整できます。

例(one-way ANOVAに基づく)

セクション3 - Optionsと追加設定

一部の解析には、結果の比較方法や計算方法を調整できる追加オプションが含まれています。これらの設定は、選択した解析に関連する場合にのみ表示され、推奨オプションが自動的に適用されます。

  • 比較
    該当する場合は、グループまたは条件の比較方法を選択します。すべてのグループを比較するか、特定の比較を選択できます。
  • フォローアップ検定
    一部の解析には、グループ間の差を詳しく調べるための任意のフォローアップ検定が含まれます。方法を選択するか、推奨オプションを使用できます。
  • 自動推奨
    BioRenderは、解析の種類とデータに基づいて適切な設定を提案しますが、必要に応じて調整できます。

例(one-way ANOVAに基づく) 

解析レポートを表示する 

解析設定を確認したら、"Run analysis"をクリックして解析レポートを表示します。 

以下のスクリーンショットの例に示すように、BioRender Graphing内の解析レポートで、解析の実行日とRのバージョンを確認できます。

結果を表示する

解析が実行されると、次のようになります。

  • 解析パネルに完全な結果テーブルと記述統計が表示されます
  • 有意な比較が、有意差マーカーとともに自動的にグラフに追加されます
  • 解析パネルのチェックボックスを使用して、グラフに表示する結果を切り替えられます
  • 同じグラフで複数の解析を実行し、表示する解析を制御できます

利用可能な解析の種類

さらに詳しく学ぶ準備はできましたか?次の記事では、解析の種類と、BioRenderのGraphingツールで統計解析を実行する方法について、次の内容を説明します。

  • t-tests
  • One-wayおよびTwo-way ANOVAs
  • 多重比較検定
  • 線形回帰およびdose-response回帰
  • 生存時間解析、ロジスティックregression、相関

→ 統計解析:利用可能な検定と実行方法

Graph Gridビューでグラフを横並びで比較する

ファイルが大きくなったら、Graph Gridビュー(Graphタブ)を使用して、ファイル内のすべてのグラフを一目で確認できます。

ビューを操作する

  • 名前でグラフを検索する
  • データセットでフィルタリングして、特定のデータテーブルのグラフに絞り込む
  • 名前、作成日、または最終更新日でSort by

注:Graph Gridビューには、現在のファイル内のグラフのみが表示されます。他のファイルのグラフはここには表示されません。

次のステップ

解析は完了しました。次は、プレゼンテーション用に仕上げましょう。BioRender Graphingの「グラフをプレゼンテーションする」に進み、次の方法を学びましょう。

  • ライブ編集とStyle Matchを使用してグラフの外観を微調整する
  • グラフをPowerPointまたはGoogle Slidesに直接挿入する
  • データの変更に合わせて、ワンクリックでグラフを最新の状態に保つ

グラフをプレゼンテーションする →

サポートが必要ですか? support@biorender.comまでサポートチームにお問い合わせいただくか、右下隅にある"Chat With Us"バブルをクリックしてライブチャットを開始してください。

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