BioRender Graphingで統計解析を実行する

BioRender Graphingには、実験データを自信を持って解釈するための、包括的な統計解析ツールが備わっています。 

どの検定を実行すればよいかわからない場合でもご安心ください。Graphingの解析ガイダンスでは、データに基づいて最適な検定を推奨します。正常性と等分散性のチェックはバックグラウンドで実行されるため、自分で調べたり専門家に相談したりする必要はありません。別の検定を選択した場合は、BioRenderがそのトレードオフを説明するため、毎回一貫した解析を実行できます。

この記事では、次の方法を説明します。

• Graphingの解析ガイダンスを適用して適切な検定を選択する - 組み込みの事前検定でデータを評価し、最適な解析を推奨するとともに、その理由をわかりやすい言葉で説明します
• 外れ値を自動的に検出して削除する - 外れ値にはすぐにフラグが付くため、その影響をプレビューし、ワンクリックで除外できます
• Run統計解析 - t-tests、ANOVAs、回帰分析など
• グラフを横並びで比較する - 複数の解析を1か所で確認し、パターンをすばやく見つけられます

解析ガイダンスの詳細

BioRenderがデータに適した検定を推奨する仕組みをご覧ください。

→ 統計解析：利用可能な検定と実行方法

外れ値の検出

外れ値の検出に関する記事では、検出の仕組みと結果の操作方法について、次の内容を詳しく説明しています。

• ROUT法の仕組みと、より単純な検定よりも複数の外れ値の処理に適している理由
• 外れ値の結果を解釈する方法
• 感度を調整する方法またはデータポイントを除外する方法
• 要件と制限（グループあたり最低4個の観測値、最大28グループ）

→ BioRender Graphingでの外れ値の検出

統計解析を実行する方法

1. Graphの編集ページで、+ Run new analysisをクリックします
2. 3つのセクションで構成されたフォームが表示されます。

セクション1

可能な場合、BioRender Graphingの解析ガイダンスが、データに基づいて最適な統計検定を自動的に推奨します。推奨された検定にはバッジが表示されます。

• ドロップダウンを開くと利用可能なすべてのオプションが表示され、推奨を変更できます。
• データの前提条件に合わない検定を選択した場合（例：データが正規分布していないときにパラメトリック検定を選択した場合）、推奨された検定が引き続き適している理由を説明する注記が表示されます。
• データが要件を満たしていない場合、一部の検定がグレー表示されることがあります。理由を確認するには、ツールチップをご覧ください。

カテゴリグループを選択する

• デフォルトでは、グラフのすべてのグループが含まれます。
• この解析に含めないグループの選択を解除します。 

例（用量反応曲線に基づく） 

セクション2 - 解析を微調整する

このセクションでは、解析の統計設定を調整できます。利用可能なオプションは、選択した解析の種類によって異なる場合があります。BioRenderはデータに対して実行された事前検定に基づいて設定を推奨しますが、必要に応じて変更できます。

• データ設定 - 解析用にデータをどのように整理するかを定義します。利用可能なオプションは、選択した方法によって異なります。
• 詳細オプション - 利用可能な場合、このセクションを展開して追加の設定にアクセスします。
• 前提条件 - 解析によっては、データに関する前提条件を設定できます。該当する場合は、これらの設定を確認して調整できます。

例（用量反応曲線に基づく） 

セクション3 - Optionsと追加設定

解析によっては、結果の比較方法や計算方法を細かく調整できる追加オプションがあります。これらの設定は、選択した解析に関連する場合にのみ表示され、推奨オプションが自動的に適用されます。

• 比較
  該当する場合、グループまたは条件の比較方法を選択します。すべてのグループを比較するか、特定の比較を選択できます。
• フォローアップ検定
  解析によっては、グループ間の差を調べるための任意のフォローアップ検定が含まれます。方法を選択するか、推奨オプションを使用できます。
• 自動推奨
  BioRenderは解析の種類とデータに基づいて適切な設定を提案しますが、必要に応じて調整できます。

例（用量反応曲線に基づく） 

解析レポートを表示する 

解析の設定を確認したら、"Run analysis"をクリックすると、解析レポートを表示できます。 

以下のスクリーンショットの例に示すように、BioRender Graphing内の解析レポートで、解析の実行日とRのバージョンを確認できます。

結果を表示する

解析が実行されると、次のようになります。

• 完全な結果テーブルと記述統計が解析パネルに表示されます
• 有意な比較が、有意差マーカー付きで自動的にグラフに追加されます
• 解析パネルのチェックボックスを使用して、グラフに表示する結果を切り替えられます
• 同じグラフで複数の解析を実行し、表示する解析を制御できます

利用可能な解析の種類

さらに詳しく学びたいですか？次の記事では、解析の種類と、BioRenderのGraphingツールで統計解析を実行する方法について、次の内容を説明します。

• t-tests
• 一元配置および二元配置ANOVAs
• 多重比較検定
• 線形回帰およびdose-response回帰
• Survival analysis、ロジスティックregression、相関

→ 統計解析：利用可能な検定と実行方法

Graph Gridビューでグラフを横並びで比較する

ファイルが大きくなったら、Graph Gridビュー（Graphタブ）を使用して、ファイル内のすべてのグラフを一覧で確認できます。

ビューを操作する

• 名前でグラフを検索する
• データセットでフィルタリングし、特定のデータテーブルのグラフに絞り込む
• 名前、作成日、または最終更新日でSort byする

注：Graph Gridビューには、現在のファイル内のグラフのみが表示されます。他のファイルのグラフはここには表示されません。

次のステップ

解析が完了しました。次は、プレゼンテーションで使える状態に仕上げましょう。BioRender Graphingでグラフをプレゼンテーションするに進み、次の方法を学びましょう。

• ライブ編集とStyle Matchでグラフの外観を微調整する
• グラフをPowerPointまたはGoogle Slidesに直接挿入する
• データの変更に合わせて、ワンクリックでグラフを最新の状態に保つ

グラフをプレゼンテーションする →

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