Creare Heatmap e Heatmap per Piastre a Pozzetti in BioRender Graphing

Se stai lavorando con dati che catturano schemi, intensità o variazioni su una struttura a griglia - come letture di temperatura, livelli di espressione genica o saggi su piastre a pozzetti - una heatmap può essere un ottimo modo per visualizzare i tuoi dati. Le Heatmap per Piastre a Pozzetti e le Heatmap ti permettono di identificare rapidamente tendenze e valori anomali utilizzando il colore per rappresentare i valori, rendendo più facile interpretare e comunicare i tuoi risultati. Ecco come puoi crearle in BioRender Graph.

Guida passo passo

Passo 1: Inserisci i tuoi dati in BioRender Graph

L'importazione dati intelligente organizzerà i tuoi dati per te.

• Ogni valore nel dataset corrisponde alla stessa posizione nella heatmap (ad esempio, riga 1, colonna 1 è nell'angolo in alto a sinistra).
• Puoi incollare direttamente i tuoi dati nel dataset.

Passo 2: Seleziona Heatmap o Heatmap per Piastra a Pozzetti e scegli le tue variabili

Clicca su ‘Crea Nuovo’. Quando apri il menu Grafico, vedrai due opzioni di heatmap: heatmap regolari e heatmap per piastre a pozzetti.

• Heatmap regolari: Versatili e utilizzabili per una varietà di dataset.
• Heatmap per piastre a pozzetti: Progettate specificamente per dati provenienti da piastre a pozzetti, con ogni cella che rappresenta una riga e una colonna della piastra.

Passo 3: Aggiungi le tue variabili

Specifica le variabili per Fattore Riga, Fattore Colonna e Valori. Fattore Riga e Fattore Colonna devono essere impostati sulle variabili che contengono gli identificatori di riga e colonna. Clicca “Continua”.

Passo 4: Personalizza la tua Heatmap o Heatmap per Piastra a Pozzetti

Puoi personalizzare molti elementi della heatmap, come per altre visualizzazioni di BioRender Graph, inclusi font, titolo del grafico e etichette degli assi.

Personalizza il tuo Asse Indipendente

Personalizza il tuo Asse Dipendente

Personalizza la tua Legenda

Personalizza il Titolo del Grafico

Personalizza i tuoi Dati di Campione

Per entrambe le heatmap e le heatmap per piastre a pozzetti:

• Normalizzazione dei dati: Applica la scala per riga o colonna. Esegue una standardizzazione Z-score per riga o colonna. Le etichette dei valori, i colori degli elementi e la barra dei colori si adatteranno automaticamente per riflettere i cambiamenti.

• Personalizzazione della barra dei colori: Clicca sulla barra dei colori per aprire il menu di personalizzazione, dove puoi cambiarne la posizione nel grafico e regolare il bordo e lo sfondo.

Solo per heatmap:

• Forma della heatmap: La forma predefinita è quadrata, ma puoi regolare il raggio degli angoli cliccando su Raggio angoli e aumentando la curvatura.
• Spaziatura e margine: Puoi regolare la spaziatura tra le celle e il margine tra le etichette di riga/colonna e le celle. Impostare la spaziatura a 0 elimina gli spazi tra i punti dati, mentre il margine aggiunge spazio extra.

Solo per heatmap per piastre a pozzetti:

• Bordo della piastra a pozzetti: Gli angoli arrotondati sono predefiniti, ma puoi regolare le impostazioni del bordo cliccando ovunque sulla heatmap.

• Personalizzazione della visualizzazione dei pozzetti: Regola la distanza tra i pozzetti, la larghezza del bordo e il colore del bordo per adattarli alla tua visualizzazione.

• Margine e padding: Il margine regola lo spazio tra le etichette di riga/colonna e la piastra, mentre il padding influisce sullo spazio tra i pozzetti e il bordo della piastra.

Suggerimenti per la risoluzione dei problemi

Pozzetti vuoti nella tua heatmap per piastra a pozzetti?

Se vuoi mostrare pozzetti vuoti insieme ai tuoi dati, assicurati di inserire nomi di riga e colonna per questi pozzetti. Se le etichette sono lasciate vuote, la heatmap potrebbe apparire incompleta.

Hai bisogno di opzioni di clustering o analisi?

Stiamo lavorando attivamente a queste funzionalità - resta sintonizzato!

Passare da un tipo di heatmap all'altro?

Puoi passare tra heatmap regolari e heatmap per piastre a pozzetti dal menu a tendina. Tieni presente che non tutte le personalizzazioni verranno mantenute, quindi potresti dover regolare alcune impostazioni dopo il passaggio. Consigliamo di duplicare il tuo grafico prima di provare un tipo di visualizzazione diverso.