BioRender Graphing est le nouvel outil de création de graphiques statistiques et d’analyse de BioRender qui transforme des données brutes en graphiques de qualité publication en quelques minutes. Il regroupe l’importation des données, la préparation automatique de vos données, la création de graphiques, la détection des valeurs aberrantes et l’analyse statistique dans un flux de travail unifié – dites adieu à la préparation manuelle des données et au changement d’outil.
Glissez-déposez vos fichiers de données sans copier-coller, créez plusieurs graphiques à partir du même jeu de données sans restructurer vos données, et utilisez les pré-tests intégrés qui recommandent le test statistique approprié et expliquent pourquoi. Vous pourrez également importer vos fichiers Prism existants – tous stockés en toute sécurité dans BioRender. Cet article couvre l’expérience complète de bout en bout – de l’importation de vos données à l’exécution et à l’interprétation des analyses.
Vue d’ensemble
Comment créer un fichier BioRender Graphing
Depuis votre Galerie :
- Cliquez sur « Create New » en haut à gauche.
- Sélectionnez « Graph »
- Cliquez sur « Graphing»
Chaque fichier BioRender Graphing est organisé en trois onglets :
- Données – Importez et gérez vos jeux de données
- Graphique – Créez, visualisez et personnalisez vos graphiques
- Analyse – Exécutez et consultez les analyses statistiques
Étape 1 : Saisir vos données
Il y a deux façons d’importer des données dans un fichier BioRender Graphing.
- Importer un jeu de données (Smart Data Import)
- Feuille de calcul vierge
Option 1 : Importer un jeu de données avec l’Importation intelligente des données
- Dans l’onglet Données, cliquez sur «Upload Dataset ».
- Sélectionnez votre fichier Excel, CSV ou .prism.
- Les fichiers contenant plusieurs feuilles afficheront toutes les feuilles disponibles – sélectionnez-les toutes ou choisissez-en une.
- Pour les fichiers .prism, l’option d’importer les graphiques et analyses est activée par défaut. Si vous ne souhaitez importer que les données brutes, décochez cette option.
- Sélectionnez les jeux de données que vous souhaitez importer.
- Cliquez sur Import Data pour confirmer.
- Vérifiez les variables détectées automatiquement dans l’aperçu d’importation.
- Modifiez les noms ou les affectations des variables si nécessaire.
-
Cliquez sur Import Data pour confirmer.
- Vérifiez les variables détectées automatiquement dans l’aperçu d’importation.
- Modifiez les noms ou les affectations des variables si nécessaire.
💡 Vous importez depuis GraphPad Prism ? BioRender supporte les fichiers .prism (format le plus récent). Les anciens fichiers .pzfx importeront uniquement les données. Consultez le guide complet : Importer depuis GraphPad Prism
Option 2 : Blank Spreadsheet
- Cliquez sur Blank Spreadsheet dans l’onglet Données.
- Copiez et collez vos données.
- Ajoutez ou supprimez des lignes et colonnes selon vos besoins en cliquant droit sur une cellule.
Cliquez sur Redétecter les variables pour analyser votre jeu de données – BioRender Graphing utilisera les étapes de l’Importation intelligente des données pour détecter automatiquement vos variables et vous préparer à créer un graphique.
Recommandations pour tous les jeux de données
- Pour l’importation : taille maximale du fichier (tous types) : 50 Mo
- Pour l’importation ou la saisie manuelle dans une feuille vierge : maximum recommandé de 5 000 points de données pour la création de graphiques et l’exécution d’analyses. Les fichiers plus volumineux peuvent entraîner des performances très lentes.
Limites recommandées des données pour les fichiers CSV ou Excel
Pour de meilleures performances, respectez ces limites :
| Limite | Valeur recommandée |
| Colonnes maximum | 50 |
| Lignes maximum | 10 000 |
Ces limites garantissent :
- Des temps de traitement rapides (moins de 10 secondes)
- La compatibilité avec les fonctionnalités d’analyse statistique
- Des importations fiables pour tous types de données
Organisation des jeux de données
Une fois importé, chaque jeu de données apparaît sous forme d’onglet en bas de l’onglet Données. Vous pouvez cliquer entre les jeux de données pour les consulter. Les variables du jeu de données actif sont listées dans le panneau de gauche.
Depuis la vue des données, vous pouvez :
- Ajouter ou supprimer manuellement des variables, lignes ou colonnes
- Renommer les variables
- Voir quels graphiques sont liés à chaque jeu de données
Étape 2 : Créer un graphique
Créer votre premier graphique
- Depuis un jeu de données dans l’onglet Données, cliquez sur "Create New Graph".
- Vous êtes redirigé vers la page Édition du graphique.
- Sélectionnez votre type de graphique (ex. : graphique à barres, graphique en colonnes, nuage de points, ligne de moyenne/médiane).
- Attribuez vos variables – l’aperçu du graphique se met à jour en temps réel au fur et à mesure que vous remplissez chaque champ.
- Une fois l’aperçu conforme, cliquez sur Continue.
Personnaliser votre graphique
Après avoir cliqué sur Continue, le panneau de personnalisation s’ouvre à droite de l’écran.
Les réglages sont organisés en sections :
Afficher les données (affiché en premier – c’est le réglage le plus couramment utilisé)
- Choisissez ce que vous souhaitez afficher : moyenne avec écart-type, moyenne avec SEM, etc.
- Activez ou désactivez l’affichage des points de données individuels.
Couleur et police
- Ajustez les couleurs du graphique, les styles et tailles de police.
Paramètres supplémentaires
- Accédez à des options avancées pour le formatage des axes, l’espacement et les lignes.
💡 Vous devez confirmer ou enregistrer les détails de votre graphique avant de pouvoir lancer une nouvelle analyse statistique ou personnaliser votre graphique. Si le bouton Lancer l’analyse semble inactif, vérifiez si le panneau des détails du graphique est toujours ouvert en mode édition – fermez-le ou confirmez-le d’abord.
Modifier les détails du graphique après sa création
Les détails du graphique (type, variables, jeu de données) peuvent être réouverts et modifiés à tout moment. Lorsque vous rouvrez les détails du graphique en mode édition, une invite vous demande si vous souhaitez conserver ou abandonner les modifications non enregistrées avant de confirmer les changements.
Étape 3 : Examiner la détection des valeurs aberrantes
La détection des valeurs aberrantes s’exécute automatiquement sur chaque graphique – vous n’avez pas besoin de la déclencher manuellement. BioRender utilise la méthode ROUT (régression robuste et suppression des valeurs aberrantes) pour détecter les valeurs aberrantes.
Ce que vous verrez
- Le nombre de valeurs aberrantes détectées apparaît dans le panneau de gauche.
- Les valeurs aberrantes sont automatiquement détectées et mises en surbrillance dans le tableau de données sous le graphique.
-
Cliquez sur le rapport des valeurs aberrantes pour ouvrir le rapport complet, qui affiche :
- Le nombre total de points de données analysés
- Le nombre de valeurs aberrantes détectées
- Une répartition des valeurs aberrantes par groupe
Ajuster la sensibilité avec le paramètre Q
Si vous souhaitez modifier la rigueur de l’identification des valeurs aberrantes, vous pouvez ajuster le paramètre Q :
- Ouvrez le rapport des valeurs aberrantes.
- Cliquez sur Mettre à jour les paramètres.
-
Saisissez une valeur Q entre 0,1 et 10 :
- Valeurs basses = plus strict (moins de valeurs aberrantes signalées)
- Valeurs élevées = plus tolérant (plus de valeurs aberrantes signalées)
- Cliquez sur Rerun pour appliquer le seuil mis à jour et voir les résultats révisés.
Astuce : Ceci est utile lorsque vous souhaitez tester à quel point une valeur aberrante est limite – par exemple, pour confirmer si un point de données est une véritable valeur aberrante ou juste à la limite.
Exclure des points de données
Vous avez deux options pour gérer les valeurs aberrantes et autres points de données que vous souhaitez exclure :
- Exclure des points de données individuels : cliquez droit sur n’importe quel point de données – y compris ceux qui ne sont pas des valeurs aberrantes – pour l’exclure manuellement.
- Exclure toutes les valeurs aberrantes détectées en une fois : utilisez la case à cocher Exclure toutes les valeurs aberrantes dans le rapport pour basculer toutes les valeurs aberrantes incluses ou exclues en un clic. Activez ou désactivez cette option pour comparer les résultats.
Étape 4 : Lancer une analyse statistique
Démarrer une analyse
- Dans la page d’édition du graphique, cliquez sur Run Analysis.
- Un formulaire structuré apparaît avec trois sections :
Section 1 – Type d’analyse
Lorsque c’est possible, l’assistant d’analyse de BioRender Graphing recommande automatiquement le test statistique le plus approprié en fonction de vos données. Le test recommandé est marqué par un badge.
- Vous pouvez passer outre la recommandation en ouvrant le menu déroulant pour voir toutes les options disponibles.
- Si vous sélectionnez un test qui ne correspond pas aux hypothèses de vos données (ex. : choisir un test paramétrique alors que les données ne sont pas normales), un avertissement expliquera pourquoi le test recommandé reste préférable.
- Certains tests peuvent apparaître grisés si vos données ne remplissent pas les conditions – pour comprendre pourquoi, consultez l’infobulle.
Sélectionner les groupes catégoriels
- Par défaut, tous les groupes du graphique sont inclus.
- Décochez les groupes que vous ne souhaitez pas inclure dans cette analyse particulière.
Section 2 – Affiner votre analyse
Cette section vous permet d’ajuster les paramètres statistiques de votre analyse. Les options disponibles peuvent varier selon le type d’analyse sélectionné. BioRender recommandera des paramètres basés sur des pré-tests effectués sur vos données, mais vous pouvez les modifier si nécessaire.
- Configuration des données : définissez comment vos données sont organisées pour l’analyse. Les options disponibles dépendront de la méthode sélectionnée.
- Options avancées : développez cette section pour accéder à des paramètres supplémentaires, si disponibles.
- Hypothèses : certaines analyses incluent des hypothèses configurables concernant vos données. Vous pouvez les consulter et les ajuster le cas échéant.
Exemple (les options disponibles peuvent varier)
Section 3 – Options et paramètres supplémentaires
Certaines analyses incluent des options supplémentaires qui vous permettent de préciser la manière dont les résultats sont comparés et calculés. Ces paramètres ne s’affichent que lorsqu’ils sont pertinents pour l’analyse sélectionnée, et les options recommandées sont appliquées automatiquement.
- Comparaisons : le cas échéant, choisissez comment les groupes ou conditions sont comparés. Cela peut inclure la comparaison de tous les groupes ou la sélection de comparaisons spécifiques.
- Test de suivi : certaines analyses incluent des tests de suivi optionnels pour explorer les différences entre groupes. Vous pouvez sélectionner une méthode ou utiliser l’option recommandée.
- Recommandations automatiques : BioRender suggérera des paramètres appropriés en fonction de votre type d’analyse et de vos données, mais vous pouvez les ajuster si nécessaire.
Exemple (les options disponibles peuvent varier)
Consultation des résultats
Une fois l’analyse lancée :
- Un tableau complet des résultats et des statistiques descriptives apparaît dans le panneau Analyse.
- Les comparaisons significatives sont automatiquement ajoutées au graphique avec des marqueurs de signification.
- Utilisez les cases à cocher dans le panneau Graphique pour afficher ou masquer les résultats sur le graphique.
- Vous pouvez lancer plusieurs analyses sur le même graphique et contrôler celles qui sont affichées.
Exemple de panneau Analyse dans l’onglet Graphique :
Gérer plusieurs graphiques : Vue en grille des graphiques
Au fur et à mesure que votre fichier s’agrandit, utilisez la Vue en grille des graphiques (onglet Graphique) pour voir tous les graphiques du fichier en un coup d’œil.
Navigation dans la vue
- Recherchez un graphique par nom
- Filtrez par jeu de données pour restreindre aux graphiques d’un tableau de données spécifique
- Triez par nom, date de création ou dernière modification
Remarque : La Vue en grille des graphiques affiche uniquement les graphiques du fichier en cours. Les graphiques d’autres fichiers n’apparaîtront pas ici.
Actions groupées
Sélectionnez un ou plusieurs graphiques pour accéder aux actions groupées :
- Dupliquer – Utile pour créer une variante d’un graphique existant (ex. : passer d’un graphique à barres à un diagramme en boîte, ou ajuster une variable)
- Style Match– Copiez le style d’un graphique et appliquez-le à d’autres (voir ci-dessous)
- Supprimer
Style Match
Réalisez des graphiques visuellement cohérents grâce à la fonction Appliquer le style en quelques clics seulement – polices, couleurs, formatage des axes, espacement, et plus encore. L’application du style d’un graphique peut se faire entièrement depuis la Vue en grille des graphiques sans ouvrir les graphiques individuellement.
Comment l’utiliser :
- Sélectionnez le graphique dont vous souhaitez copier le style depuis la Vue en grille des graphiques ou dans votre graphique individuel.
- Cliquez sur Style Match → Copy Style.
- Sélectionnez un ou plusieurs graphiques cibles.
- Cliquez sur Paste Style.
- Les graphiques sélectionnés adopteront le style du graphique initial choisi.
Lorsque vous copiez un style, vous pouvez choisir les catégories à appliquer :
- Style du graphique (coché par défaut) : Couleurs, espacement, lignes, polices
- Marquages statistiques (coché par défaut) : Comparaisons par paires, lignes de meilleure adéquation
- Taille et dimensions du graphique : Utile pour des figures de panneaux cohérentes
- Plage et échelle des axes : Utile si vous avez défini une échelle logarithmique ou un espacement personnalisé des graduations
Pour un guide complet sur l’utilisation de Appliquer le style, consultez cet article : Comment copier le style d’un graphique avec Appliquer le style dans BioRender Graphing
Exporter votre graphique et vos analyses
Comment exporter votre graphique
- Ouvrez le graphique que vous souhaitez exporter dans l’onglet Graphique.
- Cliquez sur le bouton bleu « Export » en haut à droite de votre page BioRender.
- Sélectionnez votre type de fichier et résolution préférés.
- Cliquez sur « Export » pour télécharger votre graphique.
Comment exporter vos analyses
- Ouvrez l’analyse que vous souhaitez exporter dans l’onglet Analysis.
- Cliquez sur le bouton bleu « Export » en haut à droite de votre page BioRender.
- Sélectionnez l’analyse que vous souhaitez exporter.
- Cliquez sur « Export » pour télécharger votre analyse au format .csv ou PDF.
❗Note importante : Si vous devez modifier votre graphique dans une autre application, exportez-le au format SVG pour pouvoir l’éditer dans des outils d’édition vectorielle tels qu’Adobe Illustrator, Affinity Designer, et plus encore.
Importer depuis GraphPad Prism
Si vous avez des fichiers Prism existants, vous pouvez les importer directement dans BioRender Graphing – y compris les données, graphiques et analyses.
Format de fichier supporté
- BioRender supporte le format de fichier .prism (le format Prism le plus récent).
- Les anciens fichiers .pzfx sont partiellement supportés – seules les données seront importées, pas les graphiques ni les analyses.
- Pour importer un fichier .pzfx avec les graphiques et analyses intacts, enregistrez-le d’abord au format .prism dans GraphPad Prism, puis importez-le.
Comment importer
- Dans l’onglet Données, cliquez sur Importer un jeu de données et sélectionnez votre fichier .prism.
- Tous les jeux de données du fichier apparaîtront – sélectionnez-les tous ou choisissez-en certains.
- L’option d’importer les graphiques et analyses est activée par défaut. Si vous ne souhaitez que les données brutes, décochez cette option.
- Cliquez sur Importer.
Pour plus d’informations sur l’importation de vos fichiers .prism, consultez cet article.
Ajouter des graphiques à une illustration
Vous pouvez utiliser les fichiers BioRender Graphing directement dans vos fichiers d’illustration BioRender.
- Depuis l’éditeur d’illustration – utilisez le panneau d’insertion de graphiques dans l’éditeur pour parcourir et insérer des graphiques depuis vos fichiers BioRender Graphing. Une fois sur la zone de dessin, cliquez sur les éléments individuels du graphique pour les styliser en ligne.
- Depuis la Vue en grille des graphiques – sélectionnez un ou plusieurs graphiques et utilisez Ajouter à l’illustration pour les envoyer vers un fichier d’illustration existant. Une fenêtre modale vous permettra de choisir le fichier de destination.
Remarque : Lors de la sélection d’un fichier depuis votre Galerie, repérez l’icône verte de graphique pour identifier les fichiers BioRender Graphing. Les fichiers Graphique (Classique) auront une icône grise.
