Erste Schritte mit BioRender Graphing Erste Schritte mit BioRender Graphing

Erste Schritte mit BioRender Graphing

BioRender Graphing ist BioRenders neues Tool zur statistischen Diagrammerstellung und Analyse, das Rohdaten in wenigen Minuten in publikationsreife Grafiken verwandelt. Es vereint Datenimport, automatische Datenvorbereitung, Diagrammerstellung, Ausreißererkennung und statistische Analyse in einem einheitlichen Workflow – verabschieden Sie sich von manueller Datenvorbereitung und dem Wechsel zwischen verschiedenen Tools.

Ziehen Sie Ihre Datendateien per Drag & Drop, ohne kopieren und einfügen zu müssen, erstellen Sie mehrere Diagramme aus demselben Datensatz, ohne Ihre Daten umstrukturieren zu müssen, und nutzen Sie integrierte Vortests, die den richtigen statistischen Test empfehlen und erklären, warum. Sie können auch Ihre bestehenden Prism-Dateien importieren – alle sicher in BioRender gespeichert. Dieser Artikel behandelt die vollständige End-to-End-Erfahrung – vom Import Ihrer Daten bis zur Durchführung und Interpretation von Analysen.

Übersicht

So erstellen Sie eine BioRender Graphing-Datei

Aus Ihrer Galerie:

  1. Klicken Sie oben links auf „Create New.
  2. Wählen Sie „Graph“ aus.
  3. Klicken Sie auf „Graphing“.

Jede BioRender Graphing-Datei ist in drei Registerkarten organisiert:

  1. Daten – Importieren und Verwalten Ihrer Datensätze
  2. Diagramm – Erstellen, Anzeigen und Anpassen von Diagrammen
  3. Analyse – Durchführung und Überprüfung statistischer Analysen

Schritt 1: Geben Sie Ihre Daten ein

Es gibt zwei Möglichkeiten, Daten in eine BioRender Graphing-Datei zu laden.

  1. Datensatz hochladen (Smart Data Import)
  2. Leeres Tabellenblatt

Option 1: Datensatz mit Smart Data Import hochladen

  1. Klicken Sie auf der Registerkarte „Data“ auf „Upload Dataset“.
  2. Wählen Sie Ihre Excel-, CSV- oder .prism-Datei aus.
    • Dateien mit mehreren Arbeitsblättern zeigen alle verfügbaren Blätter an – wählen Sie alle oder nur eines aus.
    • Bei .prism-Dateien ist die Option zum Importieren von Diagrammen und Analysen standardmäßig aktiviert. Wenn Sie nur die Rohdaten möchten, deaktivieren Sie diese Option.
  3. Wählen Sie die Datensätze aus, die Sie importieren möchten.
  4. Klicken Sie auf „Import Data“, um zu bestätigen.
  5. Überprüfen Sie die automatisch erkannten Variablen in der Importvorschau.
  6. Bearbeiten Sie bei Bedarf Variablennamen oder Zuordnungen.
  7. Klicken Sie auf „Import Data“, um zu bestätigen.

  8. Überprüfen Sie die automatisch erkannten Variablen in der Importvorschau.
  9. Bearbeiten Sie bei Bedarf Variablennamen oder Zuordnungen.

💡 Importieren Sie aus GraphPad Prism? BioRender unterstützt .prism-Dateien (neuestes Format). Ältere .pzfx-Dateien importieren nur Daten. Siehe die vollständige Anleitung: Importieren aus GraphPad Prism

Option 2: Blank Spreadsheet

  1. Klicken Sie auf der Registerkarte „Data“ auf „Blank Spreadsheet“.
  2. Kopieren und fügen Sie Ihre Daten ein.
  3. Fügen Sie bei Bedarf Zeilen und Spalten hinzu oder löschen Sie diese, indem Sie mit der rechten Maustaste auf eine Zelle klicken.

Klicken Sie auf „Redetect“, um Ihren Datensatz zu analysieren – BioRender Graphing verwendet die Schritte des Smart Data Import, um Ihre Variablen automatisch zu erkennen und Sie für die Diagrammerstellung vorzubereiten.

Empfehlungen für alle Datensätze

  • Maximale Dateigröße beim Hochladen (alle Dateitypen): 50 MB
  • Beim Hochladen oder manuellen Eingeben in ein leeres Tabellenblatt: Empfohlene maximale Anzahl von 5.000 Datenpunkten für Diagrammerstellung und Analyse. Größere Dateien können zu sehr langsamer Leistung führen.

Empfohlene Datenlimits für CSV- oder Excel-Dateien

Für beste Leistung halten Sie Ihre Daten innerhalb dieser Grenzen:

Limit Empfohlener Wert
Maximale Spalten 50
Maximale Zeilen 10.000

Diese Grenzen gewährleisten:

  • Schnelle Verarbeitungszeiten (unter 10 Sekunden)
  • Kompatibilität mit den Funktionen zur statistischen Analyse
  • Zuverlässige Importe über alle Datentypen hinweg

Wie Datensätze organisiert sind

Nach dem Import erscheint jeder Datensatz als Registerkarte unten in der Registerkarte „Daten“. Sie können zwischen den Datensätzen wechseln, um sie anzuzeigen. Die Variablen des aktiven Datensatzes werden im linken Bereich aufgelistet.

Aus der Datenansicht können Sie:

  • Variablen, Zeilen oder Spalten manuell hinzufügen oder löschen
  • Variablen umbenennen
  • Sehen, welche Diagramme mit jedem Datensatz verknüpft sind

Schritt 2: Erstellen Sie ein Diagramm

Erstellen Ihres ersten Diagramms

  1. Klicken Sie auf der Registerkarte „Data“ bei einem Datensatz auf „Create New Graph“.
  2. Sie gelangen zur Seite Graph Editing page.
  3. Wählen Sie Ihren Diagrammtyp aus (z. B. Balkendiagramm, Säulendiagramm, Streudiagramm, Mittelwert-/Medianlinie).
  4. Weisen Sie Ihre Variablen zu – die Diagramm-Vorschau aktualisiert sich in Echtzeit, während Sie jedes Feld ausfüllen.
  5. Wenn die Vorschau richtig aussieht, klicken Sie auf „Continue“.

Anpassen Ihres Diagramms

Nach dem Klicken auf „Continue“ öffnet sich das Anpassungsfenster rechts auf dem Bildschirm.

Die Einstellungen sind in Abschnitte gegliedert:

Daten anzeigen (zuerst angezeigt – dies ist die am häufigsten benötigte Einstellung)

  • Wählen Sie, was dargestellt werden soll: Mittelwert mit Standardabweichung, Mittelwert mit SEM usw.
  • Schalten Sie „Einzelne Datenpunkte anzeigen“ ein oder aus.

Farbe und Schriftart

  • Passen Sie Diagrammfarben, Schriftarten und -größen an.

Weitere Einstellungen

  • Greifen Sie auf erweiterte Optionen für Achsenformatierung, Abstände und Linien zu.

💡 Sie müssen Ihre Diagrammdetails bestätigen oder speichern, bevor Sie eine neue statistische Analyse durchführen oder Ihr Diagramm anpassen können. Wenn der Button „Analyse ausführen“ nicht reagiert, prüfen Sie, ob das Diagrammdetails-Fenster noch im Bearbeitungsmodus geöffnet ist – schließen oder bestätigen Sie es zuerst.

Diagrammdetails nach der Diagrammerstellung bearbeiten

Diagrammdetails (Typ, Variablen, Datensatz) können jederzeit wieder geöffnet und bearbeitet werden. Wenn Sie Diagrammdetails im Bearbeitungsmodus erneut öffnen, werden Sie gefragt, ob Sie ungespeicherte Änderungen behalten oder verwerfen möchten, bevor Sie die Änderungen bestätigen.

Schritt 3: Überprüfen der Ausreißererkennung

Die Ausreißererkennung läuft automatisch bei jedem Diagramm – Sie müssen sie nicht manuell starten. BioRender verwendet die ROUT-Methode (Robuste Regression und Entfernung von Ausreißern) zur Ausreißererkennung.

Was Sie sehen werden

  • Die Anzahl der erkannten Ausreißer wird im linken Bereich angezeigt.
  • Ausreißer werden automatisch erkannt und in der Datentabelle unter dem Diagramm hervorgehoben.
  • Klicken Sie auf den Ausreißerbericht, um den vollständigen Bericht zu öffnen, der Folgendes zeigt:
    • Gesamtzahl der analysierten Datenpunkte
    • Anzahl der erkannten Ausreißer
    • Aufschlüsselung der Ausreißer nach Gruppe

Anpassen der Sensitivität mit dem Q-Parameter

Wenn Sie die Aggressivität der Ausreißererkennung ändern möchten, können Sie den Q-Parameter anpassen:

  1. Öffnen Sie den Ausreißerbericht.
  2. Klicken Sie auf „Update Settings“.
  3. Geben Sie einen Q-Wert zwischen 0,1 und 10 ein:
    • Niedrigere Werte = strenger (weniger Ausreißer werden markiert)
    • Höhere Werte = nachsichtiger (mehr Ausreißer werden markiert)
  4. Klicken Sie auf „Rerun“, um den aktualisierten Schwellenwert anzuwenden und die überarbeiteten Ergebnisse zu sehen.

Tipp: Dies ist nützlich, wenn Sie testen möchten, wie „grenzwertig“ ein bestimmter Ausreißer ist – zum Beispiel, um zu bestätigen, ob ein Datenpunkt ein definitiver Ausreißer oder nur am Rand ist.

Ausschließen von Datenpunkten

Sie haben zwei Möglichkeiten, mit Ausreißern und anderen auszuschließenden Datenpunkten umzugehen:

  1. Einzelne Datenpunkte ausschließen: Klicken Sie mit der rechten Maustaste auf einen beliebigen Datenpunkt – auch auf Nicht-Ausreißer –, um ihn manuell auszuschließen.
  2. Alle erkannten Ausreißer auf einmal ausschließen: Verwenden Sie das Kontrollkästchen „Alle Ausreißer ausschließen“ im Ausreißerbericht, um alle Ausreißer mit einem Klick ein- oder auszuschalten. Aktivieren oder deaktivieren Sie diese Option, um Ergebnisse zu vergleichen.

Schritt 4: Führen Sie eine statistische Analyse durch

Eine Analyse starten

  1. Klicken Sie auf der Seite zur Diagrammbearbeitung auf „Run Analysis“.
  2. Ein strukturiertes Formular erscheint mit drei Abschnitten:
Abschnitt 1 – Analysetyp

Wann immer möglich, empfiehlt die Analyseführung von BioRender Graphing automatisch den passendsten statistischen Test basierend auf Ihren Daten. Der empfohlene Test ist mit einem Badge markiert.

  • Sie können die Empfehlung übersteuern, indem Sie das Dropdown öffnen und alle verfügbaren Optionen sehen.
  • Wenn Sie einen Test auswählen, der nicht zu den Annahmen Ihrer Daten passt (z. B. einen parametrischen Test bei nicht-normalverteilten Daten), wird eine Warnung angezeigt, die erklärt, warum der empfohlene Test dennoch vorzuziehen ist.
  • Einige Tests erscheinen ausgegraut, wenn Ihre Daten die Voraussetzungen nicht erfüllen – um zu verstehen, warum, lesen Sie den Tooltip.
Kategorische Gruppen auswählen
  • Standardmäßig sind alle Gruppen aus dem Diagramm enthalten.
  • Deaktivieren Sie Gruppen, die Sie in dieser Analyse nicht berücksichtigen möchten.
Abschnitt 2 – Analyse feinabstimmen

In diesem Abschnitt können Sie statistische Einstellungen für Ihre Analyse anpassen. Die verfügbaren Optionen variieren je nach gewähltem Analysetyp. BioRender empfiehlt Einstellungen basierend auf Vortests Ihrer Daten, Sie können diese jedoch bei Bedarf ändern.

  • Datenaufbau: Definieren Sie, wie Ihre Daten für die Analyse organisiert sind. Die verfügbaren Optionen hängen von Ihrer Methode ab.
  • Erweiterte Optionen: Erweitern Sie diesen Abschnitt, um weitere Konfigurationseinstellungen zu sehen, falls verfügbar.
  • Annahmen: Einige Analysen beinhalten konfigurierbare Annahmen über Ihre Daten. Wo anwendbar, können Sie diese überprüfen und anpassen.

Beispiel (verfügbare Optionen können variieren)

Abschnitt 3 – Optionen und zusätzliche Einstellungen

Einige Analysen bieten zusätzliche Optionen, mit denen Sie die Vergleichs- und Berechnungsweise der Ergebnisse verfeinern können. Diese Einstellungen werden nur angezeigt, wenn sie für Ihre gewählte Analyse relevant sind, und empfohlene Optionen werden automatisch angewendet.

  • Vergleiche: Wählen Sie, falls möglich, wie Gruppen oder Bedingungen verglichen werden sollen. Dies kann den Vergleich aller Gruppen oder die Auswahl spezifischer Vergleiche umfassen.
  • Folgetest: Einige Analysen enthalten optionale Folgetests, um Unterschiede zwischen Gruppen zu untersuchen. Sie können eine Methode auswählen oder die empfohlene Option verwenden.
  • Automatische Empfehlungen: BioRender schlägt basierend auf Ihrem Analysetyp und Ihren Daten passende Einstellungen vor, die Sie bei Bedarf anpassen können.

Beispiel (verfügbare Optionen können variieren)

Ergebnisse anzeigen

Sobald die Analyse ausgeführt wurde:

  • Erscheint eine vollständige Ergebnistabelle und deskriptive Statistik im Analyse-Bereich.
  • Signifikante Vergleiche werden automatisch mit Signifikanzmarkierungen im Diagramm hinzugefügt.
  • Verwenden Sie die Kontrollkästchen im Diagramm-Bereich, um zu steuern, welche Ergebnisse im Diagramm angezeigt werden.
  • Sie können mehrere Analysen im selben Diagramm ausführen und steuern, welche angezeigt werden.

Beispiel für den Analyse-Bereich in der Registerkarte „Diagramm“:


Verwalten mehrerer Diagramme: Graph Grid View

Wenn Ihre Datei wächst, verwenden Sie die Graph Grid View (Registerkarte „Graph“), um alle Diagramme in der Datei auf einen Blick zu sehen.

Navigation in der Ansicht

  • Suchen Sie ein Diagramm nach Namen
  • Filtern Sie nach Datensatz, um Diagramme aus einer bestimmten Datentabelle einzugrenzen
  • Sortieren nach Name, Erstellungsdatum oder letztem Änderungsdatum

Hinweis: Die Diagramm-Rasteransicht zeigt nur die Diagramme innerhalb der aktuellen Datei an. Diagramme aus anderen Dateien werden hier nicht angezeigt.

Massenaktionen

Wählen Sie ein oder mehrere Diagramme aus, um Massenaktionen auszuführen:

  • Duplizieren – Nützlich, um eine Variation eines bestehenden Diagramms zu erstellen (z. B. Wechsel von Balkendiagramm zu Boxplot oder Anpassung einer Variablen)
  • Style Match – Kopieren Sie den Stil eines Diagramms und wenden Sie ihn auf andere an (siehe unten)
  • Löschen

Style Match

Erstellen Sie optisch konsistente Diagramme mit Stil anpassen in nur wenigen Klicks – Schriftarten, Farben, Achsenformatierung, Abstände und mehr. Die Anwendung des Stils kann vollständig aus der Diagramm-Rasteransicht erfolgen, ohne einzelne Diagramme öffnen zu müssen.

So verwenden Sie es:

  1. Wählen Sie das Diagramm aus, dessen Stil Sie aus der Diagramm-Rasteransicht oder Ihrem einzelnen Diagramm kopieren möchten.
  2. Klicken Sie auf Style Match→ Copy Style.
  3. Wählen Sie ein oder mehrere Ziel-Diagramme aus.
  4. Klicken Sie auf Paste Style.
  5. Die ausgewählten Diagramme übernehmen den Stil Ihres ursprünglich gewählten Diagramms.

Beim Kopieren eines Stils können Sie auswählen, welche Kategorien angewendet werden sollen:

  • Diagramm-Styling (standardmäßig aktiviert): Farben, Abstände, Linien, Schriftarten
  • Statistik-Markierungen (standardmäßig aktiviert): Paarweise Vergleiche, Trendlinien
  • Diagrammgröße und -dimensionen: Nützlich für konsistente Panel-Abbildungen
  • Achsenbereich und -skala: Nützlich, wenn Sie eine Log-Skala oder benutzerdefinierte Tick-Abstände eingestellt haben

Für eine vollständige Anleitung zur Verwendung von Stil anpassen lesen Sie diesen Artikel: Wie Sie den Stil eines Diagramms mit Stil anpassen in BioRender Graphing kopieren


Exportieren Ihres Diagramms und Ihrer Analysen

So exportieren Sie Ihr Diagramm

  1. Öffnen Sie das Diagramm, das Sie exportieren möchten, in der Registerkarte Graphing.
  2. Klicken Sie oben rechts auf Ihrer BioRender-Seite auf den blauen Button „Export“.
  3. Wählen Sie Ihren bevorzugten Dateityp und die Auflösung aus.
  4. Klicken Sie auf „Export“, um Ihr Diagramm herunterzuladen.

So exportieren Sie Ihre Analysen

  1. Öffnen Sie die Analyse, die Sie exportieren möchten, in der Registerkarte Analysis.
  2. Klicken Sie oben rechts auf Ihrer BioRender-Seite auf den blauen Button „Export“.
  3. Wählen Sie die gewünschte Analyse aus, die Sie exportieren möchten.
  4. Klicken Sie auf „Export“, um Ihre Analyse als .csv- oder PDF-Datei herunterzuladen.

❗Wichtiger Hinweis: Wenn Sie Ihr Diagramm in einer anderen Anwendung bearbeiten müssen, exportieren Sie es als SVG-Datei. So können Sie es in Vektor-Bearbeitungstools wie Adobe Illustrator, Affinity Designer und mehr bearbeiten.


Importieren aus GraphPad Prism

Wenn Sie bereits Prism-Dateien haben, können Sie diese direkt in BioRender Graphing importieren – einschließlich der Daten, Diagramme und Analysen.

Unterstütztes Dateiformat

  • BioRender unterstützt das .prism-Dateiformat (das neueste Prism-Format).
  • Ältere .pzfx-Dateien werden teilweise unterstützt – Daten werden importiert, aber Diagramme und Analysen nicht.
  • Um eine .pzfx-Datei mit intakten Diagrammen und Analysen zu importieren, speichern Sie diese zuerst in GraphPad Prism als .prism-Datei neu und importieren Sie dann.

So importieren Sie

  1. Klicken Sie auf der Registerkarte „Data“ auf „Datensatz hochladen“ und wählen Sie Ihre .prism-Datei aus.
  2. Alle Datensätze aus der Datei werden angezeigt – wählen Sie alle oder einzelne aus.
  3. Die Option zum Importieren von Diagrammen und Analysen ist standardmäßig aktiviert. Wenn Sie nur die Rohdaten möchten, deaktivieren Sie diese Option.
  4. Klicken Sie auf „Import“.

Für weitere Informationen zum Importieren Ihrer .prism-Dateien lesen Sie diesen Artikel.


Diagramme zu einer Illustration hinzufügen

Sie können BioRender Graphing-Dateien direkt in Ihre BioRender-Illustrationsdateien verwenden.

  1. Aus dem Illustrationseditor – Verwenden Sie das Diagramm-Einfügefenster im Editor, um in Ihren BioRender Graphing-Dateien zu stöbern und Diagramme einzufügen. Klicken Sie auf der Leinwand auf einzelne Diagrammelemente, um sie inline zu stylen.
  2. Aus der Diagramm-Rasteransicht (bald verfügbar) – Wählen Sie ein oder mehrere Diagramme aus und verwenden Sie „Zur Illustration hinzufügen“, um sie in eine bestehende Illustrationsdatei zu übertragen. Ein Modalfenster lässt Sie auswählen, in welche Datei sie eingefügt werden sollen.

Hinweis: Beim Auswählen einer Datei aus Ihrer Galerie erkennen Sie BioRender Graphing-Dateien am grünen Diagrammsymbol. Diagramm-(Klassisch)-Dateien haben ein graues Symbol.

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