在 BioRender Graphing 中创建热图(Heatmaps)和孔板热图(Well Plate Heatmaps) 在 BioRender Graphing 中创建热图(Heatmaps)和孔板热图(Well Plate Heatmaps)

在 BioRender Graphing 中创建热图(Heatmaps)和孔板热图(Well Plate Heatmaps)

如果您正在处理能够捕捉网格结构中模式、强度或变化的数据(例如温度读数、基因表达水平或孔板检测数据),热图可以很好地将您的数据可视化。孔板热图和热图使用颜色表示数值,帮助您快速识别趋势和异常值,从而更轻松地解读和传达您的研究结果。以下是在 BioRender Graph 中创建热图的方法。

分步指南

第 1 步:将数据添加到 BioRender Graph

Smart Data Import 将为您整理数据。

  • 数据集中的每个值都对应热图中的相同位置(例如,第 1 行、第 1 列位于左上角)。
  • 您可以直接将自己的数据粘贴到数据集中。

第 2 步:选择热图或孔板热图,然后选择变量

点击“Create New”。打开 Graph 菜单后,您会看到两个热图选项:常规热图和孔板热图。

  • 常规热图:用途广泛,可用于各种数据集。
  • 孔板热图:专为孔板数据设计,每个单元格代表孔板中的一行和一列。

第 3 步:添加变量

为 Row Factor、Column Factor 和 Values 指定变量。Row Factor 和 Column Factor 应设置为包含行和列标识符的变量。点击 “Continue”。

第 4 步:自定义孔板热图或热图

您可以自定义热图的许多元素,与其他 BioRender Graph 可视化内容类似,包括字体、图表标题和轴标签。

自定义独立轴 

自定义从属轴

自定义图例

自定义 Graph 标题

自定义示例数据

对于热图和孔板热图:

  • 数据标准化:按行或按列应用缩放。按行或按列执行 Z 分数标准化。数值标签、元素颜色和色条将自动调整,以反映这些变化。
  • Color bar 自定义:点击色条打开自定义菜单,您可以在其中更改其在图表中的位置,并调整边框和背景。

仅适用于热图:

  • 热图形状:默认形状为正方形,但您可以点击 Corner radius 并增大曲度来调整圆角半径。
  • 间距和边距:您可以调整单元格之间的间距,以及行/列标签与单元格之间的边距。将间距设置为 0 会移除数据点之间的间隔,而边距会增加额外空间

仅适用于孔板热图:

  • 孔板边框:默认使用圆角,但您可以点击热图中的任意位置来调整边框设置。
  • 孔显示自定义:调整孔之间的间隙、边框宽度和边框颜色,以适应您的可视化效果。
  • 边距和内边距:边距用于调整行/列标签与孔板之间的间隙,而内边距则影响孔与孔板边缘之间的空间。

故障排除提示

孔板热图中有空孔?

如果您希望在数据显示的同时显示空孔,请务必为这些孔输入行名和列名。如果标签留空,热图可能会显示不完整。

需要聚类或分析选项?

我们正在积极开发这些功能,敬请期待!

想要在不同热图类型之间切换?

您可以通过下拉菜单在常规热图和孔板热图之间切换。请注意,并非所有自定义设置都会保留,因此切换后可能需要调整某些设置。我们建议您在尝试其他可视化类型之前复制图表。

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