Exécuter des analyses statistiques dans BioRender Graphing

BioRender Graphing fournit une suite complète d’outils d’analyse statistique pour vous aider à interpréter vos données expérimentales en toute confiance. 

Vous ne savez pas quel test exécuter ? Les recommandations d’analyse de Graphing suggèrent le test le plus approprié en fonction de vos données : des vérifications de normalité et d’égalité des variances sont effectuées en arrière-plan, pour vous éviter d’avoir à les rechercher ou à demander conseil à un expert. Si vous choisissez un autre test, BioRender vous explique les compromis afin que vous puissiez exécuter vos analyses de manière cohérente, à chaque fois.

📌 Bêta : L’agent Graphing est actuellement en version bêta.

Dans cet article, vous apprendrez à :

• Demander à l’agent Graphing d’exécuter une analyse pour vous.
• Appliquer les recommandations d’analyse de Graphing pour choisir le test approprié : des prétests intégrés évaluent vos données et recommandent l’analyse la plus adaptée, avec une explication en langage clair
• Détecter et supprimer automatiquement les valeurs aberrantes : elles sont signalées instantanément afin que vous puissiez prévisualiser leur impact et les exclure en un clic
• Run des analyses statistiques : t-tests, ANOVAs, régressions et plus encore
• Comparer des graphiques côte à côte : explorez plusieurs analyses au même endroit et repérez rapidement les tendances

En savoir plus sur les recommandations d’analyse

Découvrez comment BioRender recommande le test approprié pour vos données :

→ Analyse statistique : tests disponibles et instructions pour les exécuter

Détection des valeurs aberrantes

L’article complet sur la détection des valeurs aberrantes explique son fonctionnement et la manière d’utiliser les résultats, notamment :

• Le fonctionnement de la méthode ROUT et les raisons pour lesquelles elle gère mieux les valeurs aberrantes multiples que les tests plus simples
• Comment interpréter les résultats relatifs aux valeurs aberrantes
• Comment ajuster la sensibilité ou exclure des points de données
• Les exigences et limites : au moins 4 observations par groupe, jusqu’à 28 groupes

→ Détection des valeurs aberrantes dans BioRender Graphing

Run une analyse avec l’agent Graphing

1. Dans le chat, saisissez « run an analysis » ou indiquez le nom de l’analyse souhaitée. 
2. L’agent répertorie les analyses disponibles pour votre type de graphique et en recommande une. Par exemple, il peut recommander une régression non linéaire pour un ajustement EC50/IC50. 
3. Cliquez sur une suggestion ou saisissez celle que vous souhaitez. Suivez les instructions de l’agent pour configurer l’analyse.  
4. Consultez vos résultats dans l’onglet Analysis.
5. Si le résultat ne correspond pas à vos attentes, cliquez sur « Undo » pour annuler l’analyse en un clic, ou demandez à l’agent d’annuler l’action. Réessayez ensuite. Si l’agent ne peut pas effectuer une action, il vous indique ce qu’il n’a pas pu terminer.

Remarque : l’agent exécute uniquement les analyses prises en charge par Graphing, en utilisant les propres méthodes d’analyse de BioRender, les mêmes que celles utilisées par « Run new analysis ». 

Comme l’agent utilise nos outils d’analyse existants, vous bénéficiez du même badge indiquant le test recommandé, des mêmes prétests et des mêmes avertissements que ceux décrits ci-dessous. Vous profitez de tous les avantages de notre système fiable et vérifié, associés à un agent qui vous aide à piloter le flux de travail et collabore avec vous pour l’analyse et la création de graphiques.

Pour en savoir plus sur l’agent, consultez Comment utiliser l’agent IA de BioRender dans BioRender Graphing (bêta).

Vous préférez tout configurer vous-même ? Suivez les étapes ci-dessous.

Comment exécuter manuellement une analyse statistique

1. Sur la page de modification du Graph, cliquez sur « + Run new analysis »
2. Un formulaire structuré s’affiche avec trois sections :

Section 1

Lorsque cela est possible, les recommandations d’analyse de BioRender Graphing recommandent automatiquement le test statistique le plus approprié en fonction de vos données. Le test recommandé est signalé par un badge.

• Vous pouvez remplacer la recommandation en ouvrant le menu déroulant pour voir toutes les options disponibles.
• Si vous sélectionnez un test qui ne correspond pas aux hypothèses de vos données (par exemple, un test paramétrique lorsque les données ne suivent pas une loi normale), une note explique pourquoi le test recommandé reste préférable.
• Certains tests peuvent apparaître en grisé si vos données ne remplissent pas les conditions requises. Pour comprendre pourquoi, consultez l’infobulle.

Sélectionner des groupes catégoriels

• Par défaut, tous les groupes du graphique sont inclus.
• Désélectionnez les groupes que vous ne souhaitez pas inclure dans cette analyse particulière. 

Exemple (basé sur une courbe dose-réponse) 

Section 2 : affiner votre analyse

Cette section vous permet d’ajuster les paramètres statistiques de votre analyse. Les options disponibles peuvent varier selon le type d’analyse sélectionné. BioRender recommande des paramètres en fonction des prétests effectués sur vos données, mais vous pouvez les modifier si nécessaire.

• Configuration des données : définissez l’organisation de vos données pour l’analyse. Les options disponibles dépendent de la méthode sélectionnée.
• Options avancées : développez cette section pour accéder à des paramètres de configuration supplémentaires, s’ils sont disponibles.
• Hypothèses : certaines analyses incluent des hypothèses configurables concernant vos données. Le cas échéant, vous pouvez consulter et ajuster ces paramètres.

Exemple (basé sur une courbe dose-réponse) 

Section 3 : Options et paramètres supplémentaires

Certaines analyses incluent des options supplémentaires qui vous permettent d’affiner la comparaison et le calcul des résultats. Ces paramètres ne s’affichent que lorsqu’ils sont pertinents pour l’analyse sélectionnée, et les options recommandées sont appliquées automatiquement.

• Comparaisons
  Lorsque cela est possible, choisissez la manière dont les groupes ou les conditions sont comparés. Vous pouvez notamment comparer tous les groupes ou sélectionner des comparaisons spécifiques.
• Tests de suivi
  Certaines analyses incluent des tests de suivi facultatifs permettant d’examiner les différences entre les groupes. Vous pouvez sélectionner une méthode ou utiliser l’option recommandée.
• Recommandations automatiques
  BioRender suggère les paramètres appropriés en fonction du type d’analyse et de vos données, mais vous pouvez les ajuster si nécessaire.

Exemple (basé sur une courbe dose-réponse) 

Consulter le rapport d’analyse 

Après avoir vérifié la configuration de votre analyse, cliquez sur "Run analysis" pour consulter votre rapport d’analyse. 

Vous trouverez la date et la version de R utilisées lors de l’exécution de votre analyse dans le rapport d’analyse de BioRender Graphing, comme indiqué dans la capture d’écran ci-dessous.

Consulter les résultats

Une fois l’analyse exécutée :

• Un tableau complet des résultats et des statistiques descriptives s’affichent dans l’onglet Analysis
• Les comparaisons significatives sont automatiquement ajoutées au graphique avec des marqueurs de significativité
• Utilisez les cases à cocher de l’onglet Analysis pour choisir les résultats affichés sur le graphique
• Vous pouvez exécuter plusieurs analyses sur le même graphique et contrôler celles qui sont affichées

Types d’analyses disponibles

Vous souhaitez en savoir plus ? L’article suivant présente les types d’analyses et explique comment exécuter une analyse statistique dans l’outil Graphing de BioRender, notamment :

• t-tests
• ANOVAs à un facteur et à deux facteurs
• Tests de comparaisons multiples
• Régressions linéaires et de type dose-response
• Survival analysis, régression logistique et corrélation

→ Analyse statistique : tests disponibles et instructions pour les exécuter

Comparer des graphiques côte à côte avec la vue Graph Grid

À mesure que votre fichier s’agrandit, utilisez la vue Graph Grid (Graph) pour voir tous les graphiques du fichier en un coup d’œil.

Utiliser la vue

• Rechercher un graphique par son nom
• Filtrer par jeu de données pour afficher uniquement les graphiques provenant d’un tableau de données spécifique
• Sort by nom, date de création ou dernière modification

Remarque : la vue Graph Grid affiche uniquement les graphiques du fichier actuel. Les graphiques provenant d’autres fichiers n’apparaissent pas ici.

Étape suivante

Votre analyse est terminée : il est maintenant temps de la préparer pour une présentation. Accédez à Présenter vos graphiques dans BioRender Graphing pour apprendre à :

• Affiner l’apparence de votre graphique grâce à la modification en direct et à Style Match
• Insérer directement vos graphiques dans PowerPoint ou Google Slides
• Maintenir vos graphiques à jour lorsque vos données changent, en un clic

Présenter vos graphiques →

Besoin d’aide ? Contactez notre équipe d’assistance à l’adresse support@biorender.com ou démarrez une conversation en direct en cliquant sur la bulle "Chat With Us" située dans l’angle inférieur droit.