Réaliser des analyses statistiques dans BioRender Graphing

BioRender Graphing fournit une suite complète d’outils d’analyse statistique pour vous aider à interpréter vos données expérimentales en toute confiance. 

Vous ne savez pas quel test utiliser ? Les recommandations d’analyse de Graphing suggèrent le test le plus approprié en fonction de vos données, en effectuant en arrière-plan des vérifications de la normalité et de l’égalité des variances afin que vous n’ayez pas à rechercher ces informations ou à consulter un expert. Si vous choisissez un autre test, BioRender vous expliquera les compromis afin que vous puissiez réaliser vos analyses de manière cohérente, à chaque fois.

Dans cet article, vous apprendrez à :

• Appliquer les recommandations d’analyse de Graphing pour choisir le test approprié : des prétests intégrés évaluent vos données et recommandent l’analyse la plus adaptée, avec une explication en langage clair
• Détecter et supprimer automatiquement les valeurs aberrantes : les valeurs aberrantes sont signalées instantanément, afin que vous puissiez prévisualiser leur impact et les exclure en un clic
• Run des analyses statistiques : t-tests, ANOVAs, régressions et bien plus encore
• Comparer des graphiques côte à côte : explorez plusieurs analyses au même endroit et repérez rapidement les tendances

En savoir plus sur les recommandations d’analyse

Découvrez comment BioRender recommande le test approprié pour vos données :

→ Analyse statistique : tests disponibles et procédure d’exécution

Détection des valeurs aberrantes

L’article complet sur la détection des valeurs aberrantes explique le fonctionnement de la détection et la manière de travailler avec les résultats, notamment :

• Le fonctionnement de la méthode ROUT et les raisons pour lesquelles elle gère mieux les valeurs aberrantes multiples que les tests plus simples
• La manière d’interpréter les résultats concernant les valeurs aberrantes
• La manière d’ajuster la sensibilité ou d’exclure des points de données
• Les exigences et les limites (au moins 4 observations par groupe, jusqu’à 28 groupes)

→ Détection des valeurs aberrantes dans BioRender Graphing

Comment réaliser une analyse statistique

1. Sur la page de modification du Graph, cliquez sur + Run new analysis
2. Un formulaire structuré comportant trois sections s’affiche :

Section 1

Lorsque cela est possible, les recommandations d’analyse de BioRender Graphing suggèrent automatiquement le test statistique le plus approprié en fonction de vos données. Le test recommandé est signalé par un badge.

• Vous pouvez remplacer la recommandation en ouvrant le menu déroulant pour afficher toutes les options disponibles.
• Si vous sélectionnez un test qui ne correspond pas aux hypothèses de vos données (par exemple, si vous choisissez un test paramétrique alors que les données ne suivent pas une distribution normale), une note explique pourquoi le test recommandé reste préférable.
• Certains tests peuvent apparaître en grisé si vos données ne remplissent pas les conditions requises. Pour comprendre pourquoi, consultez l’infobulle.

Sélectionner des groupes catégoriels

• Par défaut, tous les groupes du graphique sont inclus.
• Désélectionnez les groupes que vous ne souhaitez pas inclure dans cette analyse particulière. 

Exemple (basé sur une courbe dose-réponse) 

Section 2 - Affiner votre analyse

Cette section vous permet d’ajuster les paramètres statistiques de votre analyse. Les options disponibles peuvent varier en fonction du type d’analyse que vous sélectionnez. BioRender recommandera des paramètres en fonction des prétests effectués sur vos données, mais vous pouvez les modifier si nécessaire.

• Configuration des données - Définissez la manière dont vos données sont organisées pour l’analyse. Les options disponibles dépendent de la méthode sélectionnée.
• Options avancées - Développez cette section pour accéder à des paramètres de configuration supplémentaires, s’ils sont disponibles.
• Hypothèses -  Certaines analyses incluent des hypothèses configurables concernant vos données. Le cas échéant, vous pouvez consulter et ajuster ces paramètres.

Exemple (basé sur une courbe dose-réponse) 

Section 3 - Options et paramètres supplémentaires

Certaines analyses incluent des options supplémentaires qui vous permettent d’affiner la manière dont les résultats sont comparés et calculés. Ces paramètres ne s’affichent que lorsqu’ils sont pertinents pour l’analyse sélectionnée, et les options recommandées sont automatiquement appliquées.

• Comparaisons
  Le cas échéant, choisissez la manière dont les groupes ou les conditions sont comparés. Il peut s’agir de comparer tous les groupes ou de sélectionner des comparaisons spécifiques.
• Tests de suivi
  Certaines analyses incluent des tests de suivi facultatifs pour explorer les différences entre les groupes. Vous pouvez sélectionner une méthode ou utiliser l’option recommandée.
• Recommandations automatiques
  BioRender suggérera les paramètres appropriés en fonction de votre type d’analyse et de vos données, mais vous pouvez les ajuster si nécessaire.

Exemple (basé sur une courbe dose-réponse) 

Consulter le rapport d’analyse 

Après avoir vérifié la configuration de votre analyse, cliquez sur "Run analysis" pour consulter votre rapport d’analyse. 

Vous trouverez la date et la version de R utilisées lors de l’exécution de votre analyse dans le rapport d’analyse de BioRender Graphing, comme indiqué dans la capture d’écran ci-dessous.

Consulter les résultats

Une fois l’analyse exécutée :

• Un tableau complet des résultats et des statistiques descriptives s’affichent dans le panneau Analyse
• Les comparaisons significatives sont automatiquement ajoutées au graphique avec des marqueurs de significativité
• Utilisez les cases à cocher du panneau Analyse pour choisir les résultats à afficher sur le graphique
• Vous pouvez exécuter plusieurs analyses sur le même graphique et contrôler celles qui sont affichées

Types d’analyses disponibles

Prêt à en savoir plus ? L’article suivant présente les types d’analyses et explique comment réaliser une analyse statistique dans l’outil Graphing de BioRender, notamment :

• t-tests
• ANOVA à un facteur et à deux facteurs ANOVAs
• Tests de comparaisons multiples
• Régressions linéaires et dose-réponse dose-response
• Survival analysis, régression logistique regression et corrélation

→ Analyse statistique : tests disponibles et procédure d’exécution

Comparer des graphiques côte à côte avec la vue Graph Grid

À mesure que votre fichier s’agrandit, utilisez la vue Graph Grid (Graph) pour voir tous les graphiques du fichier en un coup d’œil.

Utiliser la vue

• Rechercher un graphique par nom
• Filtrer par jeu de données pour afficher uniquement les graphiques provenant d’une table de données spécifique
• Sort by nom, date de création ou date de dernière modification

Remarque : la vue Graph Grid affiche uniquement les graphiques du fichier actuel. Les graphiques d’autres fichiers n’y apparaîtront pas.

Et ensuite ?

Votre analyse est terminée : il est maintenant temps de préparer votre présentation. Accédez à Présenter vos graphiques dans BioRender Graphing pour apprendre à :

• Affiner l’apparence de votre graphique grâce à la modification en direct et à Style Match
• Insérer directement vos graphiques dans PowerPoint ou Google Slides
• Maintenir vos graphiques à jour lorsque vos données changent, en un clic

Présenter vos graphiques →

Besoin d’aide ? Contactez notre équipe d’assistance à l’adresse support@biorender.com ou démarrez une conversation en direct en cliquant sur la bulle "Chat With Us" située en bas à droite.