BioRender Graphing detecta automáticamente los valores atípicos en su conjunto de datos cada vez que se crea un gráfico, sin necesidad de configuración manual. Este artículo explica cómo funciona la detección de valores atípicos, cómo interpretar los resultados y cómo ajustar la sensibilidad o excluir puntos de datos.
Cómo funciona la detección de valores atípicos
BioRender utiliza el método ROUT (Regresión robusta y eliminación de valores atípicos) para la detección de valores atípicos; para obtener más información, consulte este artículo. ROUT combina regresión no lineal robusta con un marco de Tasa de Descubrimiento Falsa (FDR) para identificar puntos de datos que probablemente no pertenezcan a la misma población que el resto del grupo.
A diferencia de métodos simples como la prueba de Grubbs, ROUT está diseñado para manejar conjuntos de datos con múltiples valores atípicos simultáneamente. No asume una distribución perfectamente normal y es menos probable que enmascare un valor atípico por la presencia de otro, un problema común conocido como efecto de enmascaramiento.
Requisitos a tener en cuenta:
- ROUT solo se ejecuta cuando un grupo tiene al menos 4 observaciones; se omiten los grupos con menos de 4 puntos
- Se aplican límites máximos: hasta 28 grupos y 5.000 observaciones por grupo
- ROUT se aplica de forma independiente dentro de cada grupo, no en todo el conjunto de datos combinado
📌 ¿Por qué ROUT? ROUT es ampliamente utilizado en la investigación preclínica y biomédica. Es robusto para conjuntos de datos donde pueden estar presentes más de un valor atípico, lo que lo hace adecuado para los tamaños de grupo pequeños a medianos típicos en biología experimental.
Qué verás
Cuando creas un gráfico, la detección de valores atípicos se ejecuta automáticamente en segundo plano. Aquí es donde puedes encontrar los resultados:
- El número de valores atípicos detectados aparece en el panel de Datos mostrados debajo del gráfico.
- Los valores atípicos se resaltan en amarillo en la tabla de datos bajo el gráfico para que puedas identificarlos de un vistazo.
- Haz clic en el enlace del informe de valores atípicos para abrir el informe completo, que incluye:
- Número total de puntos de datos analizados
- Número de valores atípicos detectados
- Desglose de valores atípicos por grupo
Ajustar la sensibilidad con el parámetro Q
El parámetro Q controla cuán agresivamente BioRender marca los valores atípicos. Se corresponde directamente con la FDR máxima que estás dispuesto a aceptar; en otras palabras, el umbral en el que un punto de datos se considera estadísticamente lo suficientemente improbable como para ser llamado valor atípico.
| Valor Q | Sensibilidad | Efecto |
| Bajo (p. ej., 0,1-1%) | Estricta | Menos puntos de datos marcados como valores atípicos: solo los valores más extremos |
| Por defecto (1%) | Equilibrada | El punto de partida estándar para la mayoría de los experimentos |
| Alto (p. ej., 5-10%) | Permisiva | Más puntos de datos marcados: útil para revisión exploratoria |
Cómo ajustar el parámetro Q
- Abre el informe de valores atípicos haciendo clic en él en el panel izquierdo.
- Haz clic en Actualizar configuración.
- Introduce un valor Q entre 0,1 y 10.
- Haz clic en Volver a ejecutar para aplicar el nuevo umbral y ver los resultados actualizados.
💡 Consejo: Ajustar Q es útil cuando quieres probar cuán borderline es un punto de datos dado. Por ejemplo, si un punto fue marcado con Q=1 pero no con Q=0,5, es un valor atípico marginal: vale la pena investigarlo, pero no es definitivamente extremo.
Excluir puntos de datos
Detectar un valor atípico no lo excluye automáticamente de tu análisis; esa es tu decisión. BioRender te ofrece dos formas de manejarlo:
| Opción | Cómo hacerlo |
| Excluir un punto de datos individual | Haz clic derecho en cualquier punto de datos del gráfico, incluidos los que no son valores atípicos, y selecciona Excluir. Esto te da control manual total sobre puntos individuales. |
| Excluir todos los valores atípicos detectados a la vez | Utiliza la casilla Excluir valores atípicos en el informe de valores atípicos para activar o desactivar todos los valores atípicos marcados con un solo clic. Actívala o desactívala para comparar tu gráfico con y sin valores atípicos. |
📌 Importante: Los puntos de datos excluidos aquí se aplican automáticamente a todos los análisis estadísticos que realices en ese gráfico. No necesitas reconfigurar tus análisis después de excluir un punto; los resultados se actualizan para reflejar la exclusión.
Buenas prácticas para manejar valores atípicos
La exclusión de valores atípicos es una decisión que debe tomarse con cuidado y documentarse de forma transparente.
Aquí tienes algunas pautas:
- Revisa primero tu escala: ROUT funciona mejor cuando los valores de un grupo están distribuidos aproximadamente de manera uniforme por encima y por debajo de la media. Si tus mediciones abarcan naturalmente muchos órdenes de magnitud (concentraciones, fluorescencia, niveles de expresión), considera transformar los datos en escala logarítmica antes de ejecutar la detección de valores atípicos. Una señal clara de que estás usando una escala incorrecta: todos los valores "atípicos" marcados están en el mismo lado de la media (todos altos o todos bajos).
- Investiga antes de excluir: Siempre investiga por qué un punto de datos es un valor atípico antes de excluirlo. ¿Fue un error de medición, un problema en el manejo de la muestra o un hallazgo biológico genuino?
- Usa Q con prudencia: El valor por defecto (Q=1%) es adecuado para la mayoría de los experimentos. Aumentar Q para marcar más puntos corre el riesgo de excluir variación real en tus datos.
- Informa tu método: Indica que BioRender utiliza el método ROUT con un valor Q especificado y señala qué puntos de datos fueron excluidos y por qué.
- Usa el interruptor para comparar: La casilla Excluir valores atípicos facilita mostrar a colaboradores o revisores el análisis tanto con como sin los valores atípicos incluidos.
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