BioRender 如何支持 FAIR 数据原则(可发现、可访问、可互操作和可复用)
FAIR 原则(可发现、可访问、可互操作和可复用)为科学数据管理提供了一个框架,有助于实现可重复性、协作以及符合资助方要求(包括 NIH 开放数据规定)。BioRender Graphing 在设计时充分考虑了透明性和可重复性,目前已支持 FAIR 原则的关键内容,并制定了进一步加强一致性的路线图。
F – Findable(可发现)
数据和分析易于查找和引用
- 可直接分享的链接:BioRender Graphing 中的每个图表和分析都可以通过持久链接分享,从而便于在实验记录本或跨团队交接中引用特定输出结果。
- 组织级共享:文件可以与个人、群组或整个组织共享,支持在实验室和机构内部进行发现。
- DOI 支持 (未来路线图中的潜在功能):BioRender 正在评估为已发布的图表和数据集分配 DOI,这将支持建立可索引、可引用的研究输出,并符合 NIH 和资助方的开放数据要求。
A – Accessible(可访问)
具有适当权限的人员可以检索数据
- 精细化访问控制:BioRender 使用权限模型,文件可以设置为view-only或编辑权限,并可在个人、群组或组织级别进行控制。
- Account 访问:目前,查看共享内容需要拥有BioRender账户。
I – Interoperable(可互操作)
数据可跨工具、平台和系统使用
- 开放导出格式:图表可以导出为 SVG、PNG 或 JPEG 格式:这些格式开放且得到广泛支持,兼容任何出版工作流、ELN 或下游工具。
- 机器可读的数据导出:底层数据和分析报告可导出为 CSV,这是一种通用格式,兼容R、Python、Excel 以及几乎所有统计或存储库平台。
- 统计输出的可移植性:分析输出包括参数和检验设置,因此可以轻松地在其他环境中复现结果或导入结果。
- 方法说明:BioRender Graphing 的统计分析由开源R软件包提供支持。此处提供了有关分析方法和R软件包的完整文档:BioRender Graphing 中的统计检验:方法、假设检查和R软件包。
R – Reusable(可重用)
数据描述清晰,可在未来工作中再次使用
- 数据与可视化一同存储:源数据与图表和分析结果存储在同一个BioRender Graphing文件中。除最终输出结果外,数据始终可供访问。
- 记录来源元数据:每项分析都会记录时间戳、所使用的R版本以及统计参数和设置,从而提供理解、复现或进一步分析该结果所需的背景信息。
- 适合存储的导出文件:分析结果可以导出为 CSV 文件,便于纳入现有的开放数据工作流。
- 版本化:BioRender Graphing 中的所有更改都会进行版本化,最终用户可以根据需要恢复早期版本。
还有疑问?您的BioRender客户团队随时可以为您提供帮助——欢迎随时联系我们。
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