开始使用 BioRender Graphing 开始使用 BioRender Graphing

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BioRender Graphing 是 BioRender 全新的统计制图和分析工具,可在几分钟内将原始数据转换为符合出版质量要求的图表。它将数据导入、自动准备数据、创建图表、异常值检测和统计分析整合到一个统一的工作流程中——告别手动准备数据和在工具之间切换。 

无需复制粘贴即可拖放数据文件;无需重新整理数据,即可从同一数据集创建多个图表;还可以使用内置的预检功能,该功能会推荐合适的统计检验并解释原因。您还可以导入现有的 Prism 文件——所有文件都会安全地存储在 BioRender 中。本文将介绍完整的端到端体验,从导入数据到运行和解读分析。

概览

如何创建 BioRender Graphing 文件 

从您的 Gallery 中:

  1. 点击左上角的“Create New”。
  2. 选择“Graph”
  3. 点击“New Graphing”

每个 BioRender Graphing 文件包含三个选项卡:

  1. 数据 -  导入和管理数据集
  2. Graph - 创建、查看和自定义图表
  3. 分析 - Run 和查看统计分析

第 1 步:Enter 您的数据

将数据添加到 BioRender Graphing 文件中有两种方式。

  1. Upload 数据集(Smart Data Import)
  2. 空白电子表格

选项 1:使用 Smart Data Import Upload 数据集

  1. 在“数据”选项卡中,点击 "Upload dataset"。
  2. 选择您的 Excel、CSV 或 .prism 文件。
    • 包含多个工作表的文件将显示所有可用工作表——选择全部或选择其中一个。
    • 对于 .prism 文件,默认开启导入图表和分析的选项。如果您只想导入原始数据,请取消选中此选项。
  3. 选择要导入的数据集。
  4. 点击“导入数据”以确认。
  5. 在导入预览中查看自动检测到的变量。
  6. 如有需要,编辑变量名称或分配。
  7. 点击“导入数据”以确认。

  8. 在导入预览中查看自动检测到的变量。
  9. 如有需要,编辑变量名称或分配。

💡 正在从 GraphPad Prism 导入?BioRender 支持 .prism 文件(最新格式)。较旧的 .pzfx 文件只能导入数据。查看完整指南:从 GraphPad Prism 导入

选项 2:Blank spreadsheet 

  1. 在“数据”选项卡中点击Blank spreadsheet。
  2. 复制并粘贴数据。
  3. 右键点击任意单元格,根据需要添加或删除行和列。

点击Re-detect variables以分析您的数据集——BioRender Graphing 将使用Smart Data Import步骤自动检测变量,帮助您准备创建图表。

适用于所有数据集的建议

  • 上传:File 大小上限(所有文件类型):50 MB
  • 上传或手动输入数据到空白电子表格:创建图表和运行分析时,Recommended 数据点上限为 5,000。超过此大小的文件可能会出现严重的性能缓慢。

CSV 或 Excel 文件的Recommended数据限制

为获得最佳性能,请将数据控制在以下限制以内:

限制 Recommended 值
最大列数 50
最大行数 10,000

这些限制可确保:

  • 处理速度快(低于 10 秒)
  • 与统计分析功能兼容
  • 适用于所有数据类型的可靠导入

数据集的组织方式

导入后,每个数据集都会作为一个选项卡显示在“数据”选项卡底部。您可以点击不同数据集之间的选项卡来查看数据集。活动数据集的变量会列在左侧面板中。

在数据视图中,您可以:

  • 手动添加或删除变量、行或列
  • Rename 变量
  • 查看哪些图表链接到了每个数据集

第 2 步:创建图表

创建您的第一个图表

  1. 在“数据”选项卡的数据集中,点击“创建新图表”。
  2. 此操作会将您带到Graph编辑页面。
  3. 选择图表类型(例如柱状图、条形图、散点图、均值/中位数线)。
  4. 分配变量——填写每个字段时,图表预览会实时更新。
  5. 预览符合预期后,点击“继续”。

自定义图表

点击“继续”后,自定义面板会在屏幕右侧打开。 

Settings 按以下部分进行组织:

显示数据(首先显示——这是最常用的设置)

  • 选择要绘制的内容:带标准差的均值、带 SEM 的均值等。
  • 打开或关闭“显示单个数据点”。

Color 和字体

  • 调整图表颜色、字体样式和大小。

其他设置

  • 访问坐标轴格式、间距和线条的更多高级选项。

💡 在运行新的统计分析或自定义图表之前,您必须确认或保存图表详细信息。如果“Run 分析”按钮没有响应,请检查图表详细信息面板是否仍处于编辑模式——先关闭或确认该面板。 

创建图表后编辑图表详细信息

Graph 详细信息(类型、变量、数据集)可以随时重新打开和编辑。在编辑模式下重新打开图表详细信息时,系统会提示您在确认更改前保留或放弃未保存的编辑内容。

第 3 步:查看异常值检测结果

异常值检测会在每个图表上自动运行——您无需手动触发。BioRender 使用 ROUT(稳健regression和异常值移除)方法检测异常值。 

您将看到的内容

  • 检测到的异常值数量会显示在左侧面板中。
  • 系统会自动检测异常值,并在图表下方的数据表中突出显示。
  • 点击异常值报告以打开完整报告,其中显示:
    • 分析的数据点总数
    • 检测到的异常值数量
    • 按组划分的异常值明细

使用 Q 参数调整灵敏度

如果您想更改识别异常值的严格程度,可以调整 Q 参数:

  1. 打开异常值报告。
  2. 点击“更新设置”。
  3. Enter 介于 0.1 和 10 之间的 Q 值:
    • 较低的值 = 更严格(标记的异常值更少)
    • 较高的值 = 更宽松(标记的异常值更多)
  4. 点击“重新运行”以应用更新后的阈值并查看修订后的结果。

提示:当您想测试某个异常值处于临界状态的程度时,这项功能非常有用——例如,确认某个数据点是明确的异常值,还是仅处于边缘。

排除数据点

您有两种方式处理异常值和其他想要排除的数据点:

  1. 排除单个数据点:右键点击任意数据点(包括非异常值)即可手动排除。 
  2. 一次性排除所有检测到的异常值:在异常值报告中使用“排除所有异常值”复选框,一键切换所有异常值的排除状态。打开或关闭此选项即可比较结果。

第 4 步:Run 统计分析

开始分析

  1. 在Graph编辑页面中,点击Run analysis。
  2. 系统会显示一个包含三个部分的结构化表单:
第 1 部分 - 分析类型 

在可能的情况下,BioRender Graphing 的分析指导会根据您的数据自动推荐最合适的统计检验。推荐的检验会以徽章标记。

  • 您可以打开下拉菜单查看所有可用选项,从而覆盖该推荐。
  • 如果您选择的检验不符合数据的假设(例如,在数据不服从正态分布时选择参数检验),警告提示会解释为什么仍然建议使用推荐的检验。
  • 如果您的数据不符合要求,某些检验可能会显示为灰色——请查看工具提示以了解原因。
选择分类组
  • 默认情况下,图表中的所有组都会被包含。
  • 取消选择不想包含在本次分析中的组。 
第 2 部分 - 微调分析

此部分允许您调整分析的统计设置。可用选项可能因您选择的分析类型而异。BioRender 会根据对您的数据运行的预检结果推荐设置,但您可以根据需要修改这些设置。

  • 数据设置:定义数据在分析中的组织方式。可用选项取决于所选方法。
  • 高级选项:如果可用,展开此部分以访问其他配置设置。
  • 假设:某些分析包含有关数据的可配置假设。在适用的情况下,您可以查看和调整这些设置。

示例(可用选项可能有所不同)

第 3 部分 - Options 和其他设置

某些分析包含其他选项,可让您优化结果的比较和计算方式。这些设置仅在与所选分析相关时显示,并且系统会自动应用推荐的选项。

  • 比较:在适用的情况下,选择组或条件的比较方式。这可能包括比较所有组或选择特定比较。
  • 后续检验:某些分析包含可选的后续检验,用于探究组之间的差异。您可以选择一种方法或使用推荐选项。
  • 自动推荐:BioRender 会根据您的分析类型和数据建议适当的设置,但您可以根据需要进行调整。

示例(可用选项可能有所不同) 

查看结果

分析运行后:

  • 分析面板中会显示完整的结果表和描述性统计数据。
  • 显著性比较会自动添加到图表中,并显示显著性标记。
  • 使用Graph面板中的复选框,切换图表上显示的结果。
  • 您可以在同一图表上运行多个分析,并控制显示哪些分析。

Graph选项卡中分析面板的示例:


管理多个图表:Graph Grid视图

随着文件内容增加,使用Graph Grid视图(Graph选项卡)即可一览文件中的所有图表。

浏览视图

  • 按名称搜索图表
  • 按数据集筛选,以缩小到特定数据表中的图表
  • 按名称、创建日期或上次修改时间Sort by

注意:Graph Grid视图仅显示当前文件中的图表。其他文件中的图表不会显示在此处。

批量操作

选择一个或多个图表以访问批量操作:

  • 复制 - 适用于创建现有图表的变体(例如,将柱状图切换为箱线图,或调整一个变量)
  • 样式匹配 - 复制一个图表的样式并应用到其他图表(见下文)
  • 删除

样式匹配

只需几次点击,即可使用Style Match创建视觉风格一致的图表——包括字体、颜色、坐标轴格式、间距等。应用图表样式的整个过程都可以在Graph Grid视图中完成,无需打开单个图表。

使用方法:

  1. 在Graph Grid视图或单个图表中,选择要复制其样式的图表。
  2. 点击“样式匹配”→Copy style。
  3. 选择一个或多个目标图表。
  4. 点击Paste style。
  5. 所选图表将匹配最初选定图表的样式。

复制样式时,您可以选择要应用的类别:

  • Graph 样式(默认选中):颜色、间距、线条、字体 
  • 统计标记(默认选中):成对比较、最佳拟合线 
  • Graph 大小和尺寸:适用于保持面板图形的一致性
  • 坐标轴范围和刻度:如果您设置了对数刻度或自定义刻度间距,此选项非常有用

如需了解如何使用Style Match的完整流程,请参阅本文:如何在 BioRender Graphing 中使用Style Match复制图表样式


导出图表和分析

如何导出图表

  1. 在Graphing选项卡中打开要导出的图表。
  2. 点击BioRender页面右上角的蓝色"Export"按钮。
  3. 选择首选的文件类型和分辨率。
  4. 点击"Export"以下载图表。

如何导出分析

  1. 在分析选项卡中打开要导出的分析。
  2. 点击BioRender页面右上角的蓝色"Export"按钮。
  3. 选择要导出的分析。
  4. 点击"Export",将分析下载为 .csv 文件或 PDF 文件。

❗重要提示:如果您需要在其他应用程序中编辑图表,请将图表导出为 SVG 文件,这样就可以在 Adobe Illustrator、Affinity Designer 等矢量编辑工具中编辑。


从 GraphPad Prism 导入

如果您已有 Prism 文件,可以将其直接导入 BioRender Graphing——包括数据、图表和分析。

支持的文件格式

  • BioRender 支持 .prism 文件格式(最新的Prism格式)。
  • 较旧的 .pzfx 文件仅部分支持——可以导入数据,但无法导入图表和分析。
  • 如需完整导入包含图表和分析的 .pzfx 文件,请先在GraphPad Prism中将其重新保存为 .prism 文件,然后再导入。

如何导入

  1. 在“数据”选项卡中,点击Upload dataset并选择您的 .prism 文件。
  2. 文件中的所有数据集都会显示出来——选择全部或选择特定数据集。
  3. 默认开启导入图表和分析的选项。如果您只想导入原始数据,请取消选中此选项。
  4. 点击“导入”。

有关导入 .prism 文件的更多信息,请参阅本文。


将图表添加到插图

您可以直接在 BioRender 插图文件中使用 BioRender Graphing 文件。

  1. 从插图编辑器中——使用编辑器中的图表插入面板,浏览并插入来自您的 BioRender Graphing 文件的图表。将图表放置到画布后,点击单个图表元素即可直接设置其样式。
  2. 从Graph Grid视图中(即将推出)——选择一个或多个图表,并使用“添加到插图”将其添加到现有插图文件中。系统会打开一个弹窗,让您选择要将图表发送到的文件。

注意:从Gallery中选择文件时,请查找绿色图表图标,以识别BioRender Graphing文件。Graph(经典版)文件将显示灰色图标。

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需要帮助?请通过support@biorender.com联系我们的支持团队,或点击右下角的"Chat With Us"气泡开始在线聊天。

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