BioRender Graphing 是 BioRender 全新的统计制图和分析工具,可在几分钟内将原始数据转换为符合出版质量要求的图表。它将数据导入、自动准备数据、创建图表、异常值检测和统计分析整合到一个统一的工作流程中——告别手动准备数据和在工具之间切换。
无需复制粘贴即可拖放数据文件;无需重新整理数据,即可从同一数据集创建多个图表;还可以使用内置的预检功能,该功能会推荐合适的统计检验并解释原因。您还可以导入现有的 Prism 文件——所有文件都会安全地存储在 BioRender 中。本文将介绍完整的端到端体验,从导入数据到运行和解读分析。
概览
如何创建 BioRender Graphing 文件
从您的 Gallery 中:
- 点击左上角的“Create New”。
- 选择“Graph”
- 点击“New Graphing”
每个 BioRender Graphing 文件包含三个选项卡:
- 数据 - 导入和管理数据集
- Graph - 创建、查看和自定义图表
- 分析 - Run 和查看统计分析
第 1 步:Enter 您的数据
将数据添加到 BioRender Graphing 文件中有两种方式。
- Upload 数据集(Smart Data Import)
- 空白电子表格
选项 1:使用 Smart Data Import Upload 数据集
- 在“数据”选项卡中,点击 "Upload dataset"。
- 选择您的 Excel、CSV 或 .prism 文件。
- 包含多个工作表的文件将显示所有可用工作表——选择全部或选择其中一个。
- 对于 .prism 文件,默认开启导入图表和分析的选项。如果您只想导入原始数据,请取消选中此选项。
- 选择要导入的数据集。
- 点击“导入数据”以确认。
- 在导入预览中查看自动检测到的变量。
- 如有需要,编辑变量名称或分配。
-
点击“导入数据”以确认。
- 在导入预览中查看自动检测到的变量。
- 如有需要,编辑变量名称或分配。
💡 正在从 GraphPad Prism 导入?BioRender 支持 .prism 文件(最新格式)。较旧的 .pzfx 文件只能导入数据。查看完整指南:从 GraphPad Prism 导入
选项 2:Blank spreadsheet
- 在“数据”选项卡中点击Blank spreadsheet。
- 复制并粘贴数据。
- 右键点击任意单元格,根据需要添加或删除行和列。
点击Re-detect variables以分析您的数据集——BioRender Graphing 将使用Smart Data Import步骤自动检测变量,帮助您准备创建图表。
适用于所有数据集的建议
- 上传:File 大小上限(所有文件类型):50 MB
- 上传或手动输入数据到空白电子表格:创建图表和运行分析时,Recommended 数据点上限为 5,000。超过此大小的文件可能会出现严重的性能缓慢。
CSV 或 Excel 文件的Recommended数据限制
为获得最佳性能,请将数据控制在以下限制以内:
| 限制 | Recommended 值 |
| 最大列数 | 50 |
| 最大行数 | 10,000 |
这些限制可确保:
- 处理速度快(低于 10 秒)
- 与统计分析功能兼容
- 适用于所有数据类型的可靠导入
数据集的组织方式
导入后,每个数据集都会作为一个选项卡显示在“数据”选项卡底部。您可以点击不同数据集之间的选项卡来查看数据集。活动数据集的变量会列在左侧面板中。
在数据视图中,您可以:
- 手动添加或删除变量、行或列
- Rename 变量
- 查看哪些图表链接到了每个数据集
第 2 步:创建图表
创建您的第一个图表
- 在“数据”选项卡的数据集中,点击“创建新图表”。
- 此操作会将您带到Graph编辑页面。
- 选择图表类型(例如柱状图、条形图、散点图、均值/中位数线)。
- 分配变量——填写每个字段时,图表预览会实时更新。
- 预览符合预期后,点击“继续”。
自定义图表
点击“继续”后,自定义面板会在屏幕右侧打开。
Settings 按以下部分进行组织:
显示数据(首先显示——这是最常用的设置)
- 选择要绘制的内容:带标准差的均值、带 SEM 的均值等。
- 打开或关闭“显示单个数据点”。
Color 和字体
- 调整图表颜色、字体样式和大小。
其他设置
- 访问坐标轴格式、间距和线条的更多高级选项。
💡 在运行新的统计分析或自定义图表之前,您必须确认或保存图表详细信息。如果“Run 分析”按钮没有响应,请检查图表详细信息面板是否仍处于编辑模式——先关闭或确认该面板。
创建图表后编辑图表详细信息
Graph 详细信息(类型、变量、数据集)可以随时重新打开和编辑。在编辑模式下重新打开图表详细信息时,系统会提示您在确认更改前保留或放弃未保存的编辑内容。
第 3 步:查看异常值检测结果
异常值检测会在每个图表上自动运行——您无需手动触发。BioRender 使用 ROUT(稳健regression和异常值移除)方法检测异常值。
您将看到的内容
- 检测到的异常值数量会显示在左侧面板中。
- 系统会自动检测异常值,并在图表下方的数据表中突出显示。
-
点击异常值报告以打开完整报告,其中显示:
- 分析的数据点总数
- 检测到的异常值数量
- 按组划分的异常值明细
使用 Q 参数调整灵敏度
如果您想更改识别异常值的严格程度,可以调整 Q 参数:
- 打开异常值报告。
- 点击“更新设置”。
-
Enter 介于 0.1 和 10 之间的 Q 值:
- 较低的值 = 更严格(标记的异常值更少)
- 较高的值 = 更宽松(标记的异常值更多)
- 点击“重新运行”以应用更新后的阈值并查看修订后的结果。
提示:当您想测试某个异常值处于临界状态的程度时,这项功能非常有用——例如,确认某个数据点是明确的异常值,还是仅处于边缘。
排除数据点
您有两种方式处理异常值和其他想要排除的数据点:
- 排除单个数据点:右键点击任意数据点(包括非异常值)即可手动排除。
- 一次性排除所有检测到的异常值:在异常值报告中使用“排除所有异常值”复选框,一键切换所有异常值的排除状态。打开或关闭此选项即可比较结果。
第 4 步:Run 统计分析
开始分析
- 在Graph编辑页面中,点击Run analysis。
- 系统会显示一个包含三个部分的结构化表单:
第 1 部分 - 分析类型
在可能的情况下,BioRender Graphing 的分析指导会根据您的数据自动推荐最合适的统计检验。推荐的检验会以徽章标记。
- 您可以打开下拉菜单查看所有可用选项,从而覆盖该推荐。
- 如果您选择的检验不符合数据的假设(例如,在数据不服从正态分布时选择参数检验),警告提示会解释为什么仍然建议使用推荐的检验。
- 如果您的数据不符合要求,某些检验可能会显示为灰色——请查看工具提示以了解原因。
选择分类组
- 默认情况下,图表中的所有组都会被包含。
- 取消选择不想包含在本次分析中的组。
第 2 部分 - 微调分析
此部分允许您调整分析的统计设置。可用选项可能因您选择的分析类型而异。BioRender 会根据对您的数据运行的预检结果推荐设置,但您可以根据需要修改这些设置。
- 数据设置:定义数据在分析中的组织方式。可用选项取决于所选方法。
- 高级选项:如果可用,展开此部分以访问其他配置设置。
- 假设:某些分析包含有关数据的可配置假设。在适用的情况下,您可以查看和调整这些设置。
示例(可用选项可能有所不同)
第 3 部分 - Options 和其他设置
某些分析包含其他选项,可让您优化结果的比较和计算方式。这些设置仅在与所选分析相关时显示,并且系统会自动应用推荐的选项。
- 比较:在适用的情况下,选择组或条件的比较方式。这可能包括比较所有组或选择特定比较。
- 后续检验:某些分析包含可选的后续检验,用于探究组之间的差异。您可以选择一种方法或使用推荐选项。
- 自动推荐:BioRender 会根据您的分析类型和数据建议适当的设置,但您可以根据需要进行调整。
示例(可用选项可能有所不同)
查看结果
分析运行后:
- 分析面板中会显示完整的结果表和描述性统计数据。
- 显著性比较会自动添加到图表中,并显示显著性标记。
- 使用Graph面板中的复选框,切换图表上显示的结果。
- 您可以在同一图表上运行多个分析,并控制显示哪些分析。
Graph选项卡中分析面板的示例:
管理多个图表:Graph Grid视图
随着文件内容增加,使用Graph Grid视图(Graph选项卡)即可一览文件中的所有图表。
浏览视图
- 按名称搜索图表
- 按数据集筛选,以缩小到特定数据表中的图表
- 按名称、创建日期或上次修改时间Sort by
注意:Graph Grid视图仅显示当前文件中的图表。其他文件中的图表不会显示在此处。
批量操作
选择一个或多个图表以访问批量操作:
- 复制 - 适用于创建现有图表的变体(例如,将柱状图切换为箱线图,或调整一个变量)
- 样式匹配 - 复制一个图表的样式并应用到其他图表(见下文)
- 删除
样式匹配
只需几次点击,即可使用Style Match创建视觉风格一致的图表——包括字体、颜色、坐标轴格式、间距等。应用图表样式的整个过程都可以在Graph Grid视图中完成,无需打开单个图表。
使用方法:
- 在Graph Grid视图或单个图表中,选择要复制其样式的图表。
- 点击“样式匹配”→Copy style。
- 选择一个或多个目标图表。
- 点击Paste style。
- 所选图表将匹配最初选定图表的样式。
复制样式时,您可以选择要应用的类别:
- Graph 样式(默认选中):颜色、间距、线条、字体
- 统计标记(默认选中):成对比较、最佳拟合线
- Graph 大小和尺寸:适用于保持面板图形的一致性
- 坐标轴范围和刻度:如果您设置了对数刻度或自定义刻度间距,此选项非常有用
如需了解如何使用Style Match的完整流程,请参阅本文:如何在 BioRender Graphing 中使用Style Match复制图表样式
导出图表和分析
如何导出图表
- 在Graphing选项卡中打开要导出的图表。
- 点击BioRender页面右上角的蓝色"Export"按钮。
- 选择首选的文件类型和分辨率。
- 点击"Export"以下载图表。
如何导出分析
- 在分析选项卡中打开要导出的分析。
- 点击BioRender页面右上角的蓝色"Export"按钮。
- 选择要导出的分析。
- 点击"Export",将分析下载为 .csv 文件或 PDF 文件。
❗重要提示:如果您需要在其他应用程序中编辑图表,请将图表导出为 SVG 文件,这样就可以在 Adobe Illustrator、Affinity Designer 等矢量编辑工具中编辑。
从 GraphPad Prism 导入
如果您已有 Prism 文件,可以将其直接导入 BioRender Graphing——包括数据、图表和分析。
支持的文件格式
- BioRender 支持 .prism 文件格式(最新的Prism格式)。
- 较旧的 .pzfx 文件仅部分支持——可以导入数据,但无法导入图表和分析。
- 如需完整导入包含图表和分析的 .pzfx 文件,请先在GraphPad Prism中将其重新保存为 .prism 文件,然后再导入。
如何导入
- 在“数据”选项卡中,点击Upload dataset并选择您的 .prism 文件。
- 文件中的所有数据集都会显示出来——选择全部或选择特定数据集。
- 默认开启导入图表和分析的选项。如果您只想导入原始数据,请取消选中此选项。
- 点击“导入”。
有关导入 .prism 文件的更多信息,请参阅本文。
将图表添加到插图
您可以直接在 BioRender 插图文件中使用 BioRender Graphing 文件。
- 从插图编辑器中——使用编辑器中的图表插入面板,浏览并插入来自您的 BioRender Graphing 文件的图表。将图表放置到画布后,点击单个图表元素即可直接设置其样式。
- 从Graph Grid视图中(即将推出)——选择一个或多个图表,并使用“添加到插图”将其添加到现有插图文件中。系统会打开一个弹窗,让您选择要将图表发送到的文件。
注意:从Gallery中选择文件时,请查找绿色图表图标,以识别BioRender Graphing文件。Graph(经典版)文件将显示灰色图标。
需要帮助?请通过support@biorender.com联系我们的支持团队,或点击右下角的"Chat With Us"气泡开始在线聊天。