Iniziare con BioRender Graphing

BioRender Graphing è il nuovo strumento di analisi e creazione di grafici statistici di BioRender, che trasforma i dati grezzi in grafici di qualità editoriale in pochi minuti. Riunisce in un unico flusso di lavoro l'importazione dei dati, la preparazione automatica dei dati, la creazione dei grafici, il rilevamento dei valori anomali e l'analisi statistica: niente più preparazione manuale dei dati o passaggi da uno strumento all'altro. 

Trascina e rilascia i file di dati senza copiare e incollare, crea più grafici dallo stesso set di dati senza ristrutturare i dati e usa i pre-test integrati che consigliano il test statistico appropriato spiegandone il motivo. Potrai anche importare i tuoi file Prism esistenti, tutti archiviati in modo sicuro in BioRender. Questo articolo illustra l'esperienza completa dall'inizio alla fine: dall'importazione dei dati all'esecuzione e all'interpretazione delle analisi.

Panoramica

Come creare un file BioRender Graphing 

Dalla Gallery:

1. Fai clic su “Create New” nell'angolo in alto a sinistra.
2. Seleziona “Graph”.
3. Fai clic su “New Graphing”.

4. Scopri cosa puoi creare. Nella finestra "Scopri cosa puoi creare con BioRender Graphing", esamina i grafici e le analisi disponibili:

• Scegli una categoria a sinistra: Confronta gruppi, Relazioni e tendenze, Curve e saggi, Parti di un intero o Sopravvivenza.
• Esplora Grafici e Analisi per quella categoria. Gli elementi nella sezione "Disponibile ora" sono pronti per l'uso.
• Controlla gli elementi "In arrivo", come Istogramma, Grafico forestale, ANOVA a tre vie e ANOVA annidata.
• Fai clic sull'icona della campana accanto a un elemento "In arrivo" per ricevere una notifica quando sarà disponibile.
• Chiudi la finestra (X) quando sei pronto a continuare.

Passaggio 1: inserisci i dati

Esistono due modi per inserire i dati in un file BioRender Graphing.

1. Carica un set di dati (Smart Data Import)
2. Foglio di calcolo vuoto

Opzione 1: carica un set di dati con Smart Data Import

1. Nella scheda Dati, fai clic su "Upload dataset".
2. Seleziona il tuo file Excel, CSV o .prism:
   • I file con più fogli mostreranno tutti i fogli disponibili: selezionali tutti oppure scegline uno. 
   • Per i file .prism, l'opzione per importare grafici e analisi è attivata per impostazione predefinita. Se vuoi importare solo i dati grezzi, deseleziona questa opzione).
3. Seleziona i set di dati che vuoi importare.
4. Fai clic su Importa dati per confermare.
5. Esamina le variabili rilevate automaticamente nell'anteprima di importazione.
6. Modifica i nomi o le assegnazioni delle variabili, se necessario.
7. Fai clic su Importa dati per confermare.
8. Esamina le variabili rilevate automaticamente nell'anteprima di importazione.
9. Modifica i nomi o le assegnazioni delle variabili, se necessario.

💡 Importi da GraphPad Prism? BioRender supporta i file .prism (formato più recente). I file .pzfx meno recenti importeranno solo i dati. Consulta la guida completa: Importazione da GraphPad Prism

Opzione 2: Blank spreadsheet 

1. Fai clic su Blank spreadsheet nella scheda Dati.
2. Copia e incolla i dati.
3. Aggiungi o elimina righe e colonne secondo necessità facendo clic con il pulsante destro del mouse su una cella qualsiasi.

Fai clic su Re-detect variables per analizzare il set di dati: BioRender Graphing utilizzerà i passaggi di Smart Data Import per rilevare automaticamente le variabili e prepararti alla creazione dei grafici.

Consigli per tutti i set di dati

• Per il caricamento: dimensione massima del File (tutti i tipi di file): 50 MB
• Per il caricamento o l'inserimento manuale dei dati in un foglio di calcolo vuoto: massimo Recommended di 5.000 punti dati per creare grafici ed eseguire analisi. I file più grandi potrebbero presentare prestazioni molto lente.

Limiti dei dati Recommended per file CSV o Excel

Per ottenere prestazioni ottimali, mantieni i dati entro questi limiti:

Questi limiti garantiscono:

• Tempi di elaborazione rapidi (inferiori a 10 secondi)
• Compatibilità con le funzionalità di analisi statistica
• Importazioni affidabili per tutti i tipi di dati

Come sono organizzati i set di dati

Ogni file BioRender Graphing è organizzato in tre schede:

1. Dati -  importa e gestisci i tuoi set di dati
2. Graph - crea, visualizza e personalizza i grafici
3. Analisi - Run ed esamina le analisi statistiche

Una volta importato, ogni set di dati appare come una scheda nella parte inferiore della scheda Dati.  Puoi fare clic tra i vari set di dati per visualizzarli. Le variabili del set di dati attivo sono elencate nel pannello a sinistra.

Dalla vista dei dati puoi:

• Aggiungere o eliminare manualmente variabili, righe o colonne
• Rinominare le variabili
• Vedere quali grafici sono collegati a ciascun set di dati

Passaggio 2: crea un grafico

Creazione del primo grafico

1. Da un set di dati nella scheda Dati, fai clic sul grafico che vuoi creare sul lato destro.

   

2. Questa operazione ti porta alla pagina di modifica del Graph.
3. Assegna le variabili: l'anteprima del grafico si aggiorna in tempo reale mentre compili ogni campo.
4. Quando l'anteprima appare corretta, fai clic su Continua.

Personalizzazione del grafico

Dopo aver fatto clic su Continua, il pannello di personalizzazione si apre sul lato destro dello schermo. 

Le Settings sono organizzate in sezioni:

Visualizza dati (mostrato per primo: è l'impostazione più comunemente necessaria)

• Scegli cosa rappresentare: media con deviazione standard, media con SEM, ecc.
• Attiva o disattiva Mostra singoli punti dati.

Colore e carattere

• Regola i colori del grafico, gli stili dei caratteri e le dimensioni.

Impostazioni aggiuntive

• Accedi alle opzioni avanzate per la formattazione degli assi, la spaziatura e le linee.

💡 Devi confermare o salvare i dettagli del grafico prima di poter eseguire una nuova analisi statistica o personalizzare il grafico. Se il pulsante Analisi Run non risponde, verifica se il pannello dei dettagli del grafico è ancora aperto in modalità di modifica: chiudilo o confermalo prima. 

Personalizza con l'IA di BioRender (Beta)

Puoi personalizzare il grafico usando l'IA di BioRender nella casella della chat Modifica rapida. Descrivi semplicemente le modifiche che vuoi apportare, come aggiornare colori, etichette, assi o stili dei punti dati, e l'IA di BioRender le applicherà per te. I dati sottostanti rimangono invariati e puoi continuare a modificare manualmente o annullare le modifiche in qualsiasi momento. Per ulteriori informazioni, consulta Personalizza i grafici con l'IA di BioRender (Beta).

Esempio: "Per tutti i punti dati con attività superiore al 98% o inferiore al 2%, imposta il riempimento rosso"

Modifica dei dettagli del grafico dopo la sua creazione

I dettagli del Graph (tipo, variabili, set di dati) possono essere riaperti e modificati in qualsiasi momento. Quando riapri i dettagli del grafico in modalità di modifica, una richiesta ti chiederà se vuoi mantenere o eliminare le modifiche non salvate prima di confermare le modifiche.

Passaggio 3: esamina il rilevamento dei valori anomali

Il rilevamento dei valori anomali viene eseguito automaticamente su ogni grafico: non è necessario avviarlo manualmente. BioRender usa il metodo ROUT (regression robusta e rimozione dei valori anomali) per il rilevamento dei valori anomali. 

Cosa vedrai

• Il numero di valori anomali rilevati appare nel pannello a sinistra.
• I valori anomali vengono rilevati ed evidenziati automaticamente nella tabella dei dati sotto il grafico.
• Fai clic sul rapporto dei valori anomali per aprire il rapporto completo, che mostra:
  • Numero totale di punti dati analizzati
  • Numero di valori anomali rilevati
  • Dettaglio dei valori anomali per gruppo

Regolazione della sensibilità con il parametro Q

Se vuoi modificare il livello di severità con cui vengono identificati i valori anomali, puoi regolare il parametro Q:

1. Apri il rapporto dei valori anomali.
2. Fai clic su Aggiorna impostazioni.
3. Inserisci un valore Q compreso tra 0,1 e 10:
   • Valori inferiori = più rigoroso (vengono segnalati meno valori anomali)
   • Valori superiori = più permissivo (vengono segnalati più valori anomali)
4. Fai clic su Esegui di nuovo per applicare la soglia aggiornata e visualizzare i risultati modificati.

Suggerimento: questa funzione è utile quando vuoi verificare quanto sia borderline un determinato valore anomalo, ad esempio per confermare se un punto dati è un valore anomalo definitivo o si trova semplicemente al limite.

Esclusione dei punti dati

Hai due opzioni per gestire i valori anomali e gli altri punti dati che vuoi escludere:

1. Escludere singoli punti dati: fai clic con il pulsante destro del mouse su qualsiasi punto dati, inclusi quelli non anomali, per escluderlo manualmente. 
2. Escludere tutti i valori anomali rilevati contemporaneamente: usa la casella di controllo Escludi tutti i valori anomali nel rapporto dei valori anomali per attivare o disattivare tutti i valori anomali con un solo clic. Attivala o disattivala per confrontare i risultati.

Per ulteriori informazioni, consulta Informazioni sul rilevamento dei valori anomali (metodo ROUT).

Passaggio 4: Run un'analisi statistica

Avvio di un'analisi

1. Nella pagina di modifica del Graph, fai clic su Run analysis.
2. Viene visualizzato un modulo strutturato con tre sezioni:

Sezione 1 - Tipo di analisi 

Quando possibile, la guida all'analisi di BioRender Graphing consiglia automaticamente il test statistico più appropriato in base ai tuoi dati. Il test consigliato è contrassegnato da un badge.

• Puoi ignorare il consiglio aprendo il menu a discesa per visualizzare tutte le opzioni disponibili.
• Se selezioni un test che non corrisponde alle ipotesi dei tuoi dati (ad esempio, scegliendo un test parametrico quando i dati non sono normali), un avviso spiegherà perché il test consigliato è comunque preferibile.
• Alcuni test potrebbero apparire disattivati se i tuoi dati non soddisfano i requisiti: per capire perché, consulta il tooltip.

Seleziona i gruppi categorici

• Per impostazione predefinita, sono inclusi tutti i gruppi del grafico.
• Deseleziona i gruppi che non vuoi includere in questa analisi specifica. 

Sezione 2 - Perfeziona l'analisi

Questa sezione consente di regolare le impostazioni statistiche per l'analisi. Le opzioni disponibili possono variare a seconda del tipo di analisi selezionato. BioRender consiglierà le impostazioni in base ai pre-test eseguiti sui tuoi dati, ma puoi modificarle se necessario.

• Configurazione dei dati: definisci come sono organizzati i dati per l'analisi. Le opzioni disponibili dipendono dal metodo selezionato.
• Opzioni avanzate: espandi questa sezione per accedere a ulteriori impostazioni di configurazione, se disponibili.
• Ipotesi: alcune analisi includono ipotesi configurabili sui dati. Se applicabile, puoi esaminare e regolare queste impostazioni.

Esempio (le opzioni disponibili possono variare)

Sezione 3 - Options e impostazioni aggiuntive

Alcune analisi includono opzioni aggiuntive che consentono di perfezionare il modo in cui i risultati vengono confrontati e calcolati. Queste impostazioni vengono mostrate solo quando sono pertinenti all'analisi selezionata e le opzioni consigliate vengono applicate automaticamente.

• Confronti: se applicabile, scegli come confrontare gruppi o condizioni. Può includere il confronto di tutti i gruppi o la selezione di confronti specifici.
• Test di follow-up: alcune analisi includono test di follow-up facoltativi per esplorare le differenze tra i gruppi. Puoi selezionare un metodo o usare l'opzione consigliata.
• Consigli automatici: BioRender suggerirà le impostazioni appropriate in base al tipo di analisi e ai dati, ma puoi modificarle se necessario.

Esempio (le opzioni disponibili possono variare) 

Visualizzazione dei risultati

Una volta eseguita l'analisi:

• Nel pannello Analisi vengono visualizzati una tabella completa dei risultati e le statistiche descrittive.
• I confronti significativi vengono aggiunti automaticamente al grafico con indicatori di significatività.
• Usa le caselle di controllo nel pannello Graph per attivare o disattivare i risultati visualizzati sul grafico.
• Puoi eseguire più analisi sullo stesso grafico e controllare quali visualizzare.

Esempio del pannello Analisi nella scheda Graph:

Gestione di più grafici: vista Graph Grid

Man mano che il file cresce, usa la vista Graph Grid (scheda Graph) per visualizzare rapidamente tutti i grafici del file.

Navigazione nella vista

• Cerca un grafico per nome
• Filtra per set di dati per restringere la ricerca ai grafici di una tabella dati specifica
• Sort by nome, data di creazione o ultima modifica

Nota: la vista Graph Grid mostra solo i grafici contenuti nel file corrente. I grafici di altri file non verranno visualizzati qui.

Azioni in blocco

Seleziona uno o più grafici per accedere alle azioni in blocco:

• Duplica: utile per creare una variante di un grafico esistente, ad esempio passando da un grafico a barre a un box plot o modificando una variabile
• Corrispondenza dello stile: copia lo stile di un grafico e applicalo ad altri grafici (vedi sotto)
• Elimina

Corrispondenza dello stile

Rendi visivamente coerenti i grafici usando Style Match con pochi clic: caratteri, colori, formattazione degli assi, spaziatura e altro. L'applicazione dello stile di un grafico può essere eseguita interamente dalla vista Graph Grid, senza aprire i singoli grafici.

Come utilizzarla:

1. Seleziona il grafico da cui vuoi copiare lo stile nella vista Graph Grid o nel grafico singolo.
2. Fai clic su Corrispondenza dello stile → Copy style.
3. Seleziona uno o più grafici di destinazione.
4. Fai clic su Paste style.
5. I grafici selezionati adotteranno lo stile del grafico scelto inizialmente.

Quando copi uno stile, puoi scegliere quali categorie applicare:

• Stile del Graph (selezionato per impostazione predefinita): colori, spaziatura, linee, caratteri 
• Indicatori statistici (selezionati per impostazione predefinita): confronti a coppie, linee di best-fit 
• Dimensioni del Graph: utile per figure con pannelli coerenti
• Intervallo e scala dell'asse: utile se hai impostato una scala logaritmica o una spaziatura personalizzata delle tacche

Per una guida completa sull'uso di Style Match, consulta questo articolo: Come copiare lo stile di un grafico usando Style Match in BioRender Graphing

Esportazione del grafico e delle analisi

Come esportare il grafico

1. Apri il grafico che vuoi esportare nella scheda Graphing.
   • Assicurati di trovarti nella scheda corretta (Dati, Graph, Analisi). Verrà scaricata la scheda selezionata.
2. Fai clic sul pulsante blu "Export" in alto a destra nella pagina di BioRender.
3. Seleziona il tipo di file e la risoluzione che preferisci.
4. Fai clic su "Export" per scaricare il grafico.

Come esportare le analisi

1. Apri l'analisi che vuoi esportare nella scheda Analisi.
2. Fai clic sul pulsante blu "Export" in alto a destra nella pagina di BioRender.
3. Seleziona l'analisi che vuoi esportare.
4. Fai clic su "Export" per scaricare l'analisi come file .csv o PDF.

❗Nota importante: se devi modificare il grafico in un'altra applicazione, esportalo come file SVG e potrai modificarlo con strumenti di modifica vettoriale come Adobe Illustrator, Affinity Designer e altri.

Importazione da GraphPad Prism

Se disponi di file Prism esistenti, puoi importarli direttamente in BioRender Graphing, inclusi dati, grafici e analisi.

Formato file supportato

• BioRender supporta il formato di file .prism (il formato più recente di Prism).
• I file .pzfx meno recenti sono supportati parzialmente: verranno importati i dati, ma non i grafici e le analisi.
• Per importare un file .pzfx mantenendo grafici e analisi, salvalo nuovamente come file .prism in GraphPad Prism, quindi importalo.

Come importare

1. Nella scheda Dati, fai clic su Upload dataset e seleziona il file .prism.
2. Verranno visualizzati tutti i set di dati del file: selezionali tutti oppure scegline alcuni.
3. L'opzione per importare grafici e analisi è attivata per impostazione predefinita. Se vuoi importare solo i dati grezzi, deseleziona questa opzione.
4. Fai clic su Importa.

Per ulteriori informazioni sull'importazione dei file .prism, consulta questo articolo.

Aggiunta di grafici a un'illustrazione

Puoi usare i file BioRender Graphing direttamente nei file di illustrazioni di BioRender.

1. Dall'editor delle illustrazioni: usa il pannello di inserimento dei grafici nell'editor per sfogliare e inserire i grafici dai tuoi file BioRender Graphing. Una volta inserito il grafico nella tela, fai clic sui singoli elementi per modificarne lo stile direttamente.
2. Dalla vista Graph Grid: seleziona uno o più grafici e usa Aggiungi all'illustrazione per inserirli in un file di illustrazione esistente. Una finestra modale ti consentirà di scegliere il file a cui inviarli.

Hai bisogno di aiuto? Contatta il nostro team di assistenza all'indirizzo support@biorender.com oppure avvia una chat dal vivo facendo clic sul fumetto "Chat With Us" nell'angolo in basso a destra.