Iniziare con BioRender Graphing Iniziare con BioRender Graphing

Iniziare con BioRender Graphing

BioRender Graphing è il nuovo strumento di grafici statistici e analisi di BioRender che trasforma dati grezzi in grafici di qualità pubblicabile in pochi minuti. Riunisce importazione dati, preparazione automatica dei dati, creazione di grafici, rilevamento degli outlier e analisi statistiche in un unico flusso di lavoro unificato - addio alla preparazione manuale dei dati e al cambio continuo di strumenti.

Trascina e rilascia i tuoi file di dati senza copiare e incollare, crea più grafici dallo stesso set di dati senza ristrutturare i dati, e utilizza i pre-test integrati che raccomandano il test statistico giusto e spiegano il motivo. Potrai anche importare i tuoi file Prism esistenti - tutti conservati in modo sicuro in BioRender. Questo articolo copre l'intera esperienza end-to-end - dall'importazione dei dati all'esecuzione e interpretazione delle analisi.

Panoramica

Come creare un file BioRender Graphing

Dalla tua Galleria:

  1. Clicca su “Create New” nell'angolo in alto a sinistra.
  2. Seleziona “Graph”
  3. Clicca su " Graphing”

Ogni file BioRender Graphing è organizzato in tre schede:

  1. Dati - Importa e gestisci i tuoi set di dati
  2. Grafico - Crea, visualizza e personalizza i grafici
  3. Analisi - Esegui e rivedi analisi statistiche

Passo 1: Inserisci i tuoi dati

Ci sono due modi per inserire dati in un file BioRender Graphing.

  1. Carica un set di dati (Smart Data Import)
  2. Blank Spreadsheet

Opzione 1: Carica un set di dati con Importazione dati intelligente

  1. Nella scheda Dat, clicca su "Upload dataset".
  2. Seleziona il tuo file Excel, CSV o .prism.
    • I file con più fogli mostreranno tutti i fogli disponibili - seleziona tutti o scegli uno.
    • Per i file .prism, l'opzione per importare grafici e analisi è attivata di default. Se vuoi solo i dati grezzi, deseleziona questa opzione.
  3. Seleziona i set di dati che vuoi importare.
  4. Clicca su Import data per confermare.
  5. Rivedi le variabili rilevate automaticamente nell'anteprima di importazione.
  6. Modifica i nomi o le assegnazioni delle variabili se necessario.
  7. Clicca su Import data per confermare.

  8. Rivedi le variabili rilevate automaticamente nell'anteprima di importazione.
  9. Modifica i nomi o le assegnazioni delle variabili se necessario.

💡 Importi da GraphPad Prism? BioRender supporta i file .prism (formato più recente). I file .pzfx più vecchi importeranno solo i dati. Consulta la guida completa: Importazione da GraphPad Prism

Opzione 2: Blank Spreadsheet

  1. Clicca su Blank Spreadsheet nella scheda Dat.
  2. Copia e incolla i tuoi dati.
  3. Aggiungi o elimina righe e colonne secondo necessità cliccando con il tasto destro su una cella.

Clicca su "Re-detect variables" per analizzare il tuo set di dati - BioRender Graphing utilizzerà i passaggi di Importazione dati intelligente per rilevare automaticamente le tue variabili e prepararti a creare grafici.

Raccomandazioni per tutti i set di dati

  • Per l'upload: Dimensione massima file (tutti i tipi di file): 50 MB
  • Per l'upload o inserimento manuale in foglio di calcolo vuoto: Massimo consigliato di 5.000 punti dati per la creazione di grafici e l'esecuzione di analisi. File più grandi potrebbero avere prestazioni molto lente.

Limiti consigliati per dati CSV o Excel

Per le migliori prestazioni, mantieni i dati entro questi limiti:

Limite Valore consigliato
Colonne massime 50
Righe massime 10.000

Questi limiti garantiscono:

  • Tempi di elaborazione rapidi (meno di 10 secondi)
  • Compatibilità con le funzionalità di analisi statistica
  • Importazioni affidabili per tutti i tipi di dati

Come sono organizzati i set di dati

Una volta importati, ogni set di dati appare come una scheda in fondo alla scheda Dati. Puoi cliccare tra i set di dati per visualizzarli. Le variabili per il set di dati attivo sono elencate nel pannello a sinistra.

Dalla visualizzazione dati, puoi:

  • Aggiungere o eliminare manualmente variabili, righe o colonne
  • Rinominare variabili
  • Vedere quali grafici sono collegati a ciascun set di dati

Passo 2: Crea un grafico

Creare il tuo primo grafico

  1. Da un set di dati nella scheda Data, clicca su Create New Graph.
  2. Verrai portato alla pagina di Graph Editing.
  3. Seleziona il tipo di grafico (ad esempio, grafico a barre, grafico a colonne, scatter plot, linea media/mediana).
  4. Assegna le tue variabili - l'anteprima del grafico si aggiorna in tempo reale mentre compili ogni campo.
  5. Quando l'anteprima è corretta, clicca Continue.

Personalizzare il tuo grafico

Dopo aver cliccato Continue, si apre il pannello di personalizzazione sul lato destro dello schermo.

Le impostazioni sono organizzate in sezioni:

Visualizza dati (mostrato per primo - è l'impostazione più comunemente necessaria)

  • Scegli cosa tracciare: media con deviazione standard, media con SEM, ecc.
  • Attiva o disattiva la visualizzazione dei singoli punti dati.

Colore e font

  • Regola colori del grafico, stili e dimensioni dei font.

Impostazioni aggiuntive

  • Accedi a opzioni più avanzate per la formattazione degli assi, spaziatura e linee.

💡 Devi confermare o salvare i dettagli del grafico prima di poter eseguire una nuova analisi statistica o personalizzare il grafico. Se il pulsante Esegui analisi sembra non rispondere, verifica se il pannello dei dettagli del grafico è ancora aperto in modalità modifica - chiudilo o confermalo prima.

Modificare i dettagli del grafico dopo la creazione

I dettagli del grafico (tipo, variabili, set di dati) possono essere riaperti e modificati in qualsiasi momento. Quando riapri i dettagli del grafico in modalità modifica, verrà chiesto se vuoi mantenere o scartare eventuali modifiche non salvate prima di confermare le modifiche.

Passo 3: Rivedi il rilevamento degli outlier

Il rilevamento degli outlier viene eseguito automaticamente su ogni grafico - non è necessario attivarlo manualmente. BioRender utilizza il metodo ROUT (Regressione robusta e rimozione outlier) per il rilevamento degli outlier.

Cosa vedrai

  • Il numero di outlier rilevati appare nel pannello a sinistra.
  • Gli outlier sono automaticamente rilevati e evidenziati nella tabella dati sotto il grafico.
  • Clicca sul rapporto degli outlier per aprire il rapporto completo, che mostra:
    • Numero totale di punti dati analizzati
    • Numero di outlier rilevati
    • Una suddivisione degli outlier per gruppo

Regolare la sensibilità con il parametro Q

Se vuoi modificare quanto aggressivamente vengono identificati gli outlier, puoi regolare il parametro Q:

  1. Apri il rapporto degli outlier.
  2. Clicca su "Update Settings".
  3. Inserisci un valore Q tra 0,1 e 10:
    • Valori più bassi = più severo (meno outlier segnalati)
    • Valori più alti = più permissivo (più outlier segnalati)
  4. Clicca su "Rerun" per applicare la soglia aggiornata e vedere i risultati rivisti.

Suggerimento: Questo è utile quando vuoi testare quanto borderline sia un dato outlier - per esempio, per confermare se un punto dati è un outlier definitivo o solo al limite.

Escludere punti dati

Hai due opzioni per gestire outlier e altri punti dati che vuoi escludere:

  1. Escludere singoli punti dati: clicca con il tasto destro su qualsiasi punto dati - inclusi quelli non outlier - per escluderlo manualmente.
  2. Escludere tutti gli outlier rilevati in una volta: usa la casella Escludi tutti gli outlier nel rapporto degli outlier per attivare o disattivare tutti gli outlier con un clic. Attiva o disattiva per confrontare i risultati.

Passo 4: Eseguire un'analisi statistica

Avviare un'analisi

  1. Nella pagina di modifica del grafico, clicca su "Run Analysis".
  2. Appare un modulo strutturato con tre sezioni:
Sezione 1 - Tipo di analisi

Quando possibile, la guida all'analisi di BioRender Graphing raccomanda automaticamente il test statistico più appropriato basato sui tuoi dati. Il test raccomandato è contrassegnato con un badge.

  • Puoi ignorare la raccomandazione aprendo il menu a tendina per vedere tutte le opzioni disponibili.
  • Se selezioni un test che non corrisponde alle assunzioni dei tuoi dati (ad esempio, scegliere un test parametrico quando i dati non sono normali), una raccomandazione di avviso spiegherà perché il test raccomandato è comunque preferibile.
  • Alcuni test possono apparire disabilitati se i dati non soddisfano i requisiti - per capire il motivo, consulta il tooltip.

Seleziona gruppi categorici
  • Per impostazione predefinita, tutti i gruppi del grafico sono inclusi.
  • Deseleziona i gruppi che non vuoi includere in questa particolare analisi.
Sezione 2 - Affina la tua analisi

Questa sezione ti permette di regolare le impostazioni statistiche per la tua analisi. Le opzioni disponibili possono variare a seconda del tipo di analisi selezionata. BioRender raccomanderà impostazioni basate su pre-test eseguiti sui tuoi dati, ma puoi modificarle se necessario.

  • Configurazione dati: Definisci come sono organizzati i tuoi dati per l'analisi. Le opzioni disponibili dipenderanno dal metodo selezionato.
  • Opzioni avanzate: Espandi questa sezione per accedere a ulteriori impostazioni di configurazione, se disponibili.
  • Assunzioni: Alcune analisi includono assunzioni configurabili sui tuoi dati. Dove applicabile, puoi rivedere e regolare queste impostazioni.

Esempio (le opzioni disponibili possono variare)

Sezione 3 - Opzioni e impostazioni aggiuntive

Alcune analisi includono opzioni aggiuntive che ti permettono di affinare come i risultati sono confrontati e calcolati. Queste impostazioni sono mostrate solo quando rilevanti per l'analisi selezionata, e le opzioni raccomandate sono applicate automaticamente.

  • Confronti: Dove applicabile, scegli come confrontare gruppi o condizioni. Questo può includere confrontare tutti i gruppi o selezionare confronti specifici.
  • Test di follow-up: Alcune analisi includono test di follow-up opzionali per esplorare differenze tra gruppi. Puoi selezionare un metodo o usare l'opzione raccomandata.
  • Raccomandazioni automatiche: BioRender suggerirà impostazioni appropriate basate sul tipo di analisi e dati, ma puoi modificarle se necessario.

Esempio (le opzioni disponibili possono variare)

Visualizzare i risultati

Una volta eseguita l'analisi:

  • Una tabella completa dei risultati e statistiche descrittive appaiono nel pannello Analisi.
  • I confronti significativi sono automaticamente aggiunti al grafico con marcatori di significatività.
  • Usa le caselle di controllo nel pannello Grafico per attivare o disattivare quali risultati mostrare sul grafico.
  • Puoi eseguire più analisi sullo stesso grafico e controllare quali sono visualizzate.

Esempio di pannello Analisi nella scheda Graph:


Gestire più grafici: Vista Graph Grid

Man mano che il tuo file cresce, usa la Vista Graph Grid (scheda Graph) per vedere tutti i grafici nel file in un colpo d'occhio.

Navigare nella vista

  • Cerca un grafico per nome
  • Filtra per set di dati per restringere ai grafici di una tabella dati specifica
  • Ordina per nome, data di creazione o ultima modifica

Nota: La Vista Graph Grid mostra solo i grafici all'interno del file corrente. I grafici di altri file non appariranno qui.

Azioni di massa

Seleziona uno o più grafici per accedere ad azioni di massa:

  • Duplica - Utile per creare una variante di un grafico esistente (ad esempio, passare da un grafico a barre a un box plot, o modificare una variabile)
  • Style Match - Copia lo stile di un grafico e applicalo ad altri (vedi sotto)
  • Elimina

Style Match

Crea grafici visivamente coerenti usando Copia Stile con pochi clic - font, colori, formattazione degli assi, spaziatura e altro. Applicare lo stile di un grafico può essere fatto completamente dalla Vista Griglia Grafici senza aprire i singoli grafici.

Come usarlo:

  1. Seleziona il grafico di cui vuoi copiare lo stile dalla Vista Griglia Grafici o dal grafico individuale.
  2. Clicca su Style Match → Copy Style.
  3. Seleziona uno o più grafici di destinazione.
  4. Clicca su Paste Style.
  5. I grafici selezionati adotteranno lo stile del grafico iniziale scelto.

Quando copi uno stile, puoi scegliere quali categorie applicare:

  • Stile grafico (selezionato di default): Colori, spaziatura, linee, font
  • Marcature statistiche (selezionato di default): Confronti a coppie, linee di miglior adattamento
  • Dimensioni e dimensioni del grafico: Utile per figure di pannelli coerenti
  • Intervallo e scala degli assi: Utile se hai impostato una scala logaritmica o spaziatura personalizzata dei tick

Per una guida completa su come usare Copia Stile, vedi questo articolo: Come copiare lo stile di un grafico usando Copia Stile in BioRender Graphing


Esportare il tuo grafico e le analisi

Come esportare il tuo grafico

  1. Apri il grafico che vuoi esportare nella scheda Graphing.
  2. Clicca il pulsante blu "Export" in alto a destra nella tua pagina BioRender.
  3. Seleziona il tipo di file e la risoluzione preferiti.
  4. Clicca su "Export" per scaricare il tuo grafico.

Come esportare le tue analisi

  1. Apri l'analisi che vuoi esportare nella scheda Anlysis.
  2. Clicca il pulsante blu "Export" in alto a destra nella tua pagina BioRender.
  3. Seleziona l'analisi desiderata da esportare.
  4. Clicca su "Export" per scaricare l'analisi come file .csv o PDF.

❗Nota importante: Se devi modificare il tuo grafico in un'altra applicazione, esportalo come file SVG e potrai modificarlo con strumenti di editing vettoriale come Adobe Illustrator, Affinity Designer e altri.


Importazione da GraphPad Prism

Se hai file Prism esistenti, puoi importarli direttamente in BioRender Graphing - inclusi dati, grafici e analisi.

Formato file supportato

  • BioRender supporta il formato file .prism (il formato Prism più recente).
  • I file .pzfx più vecchi sono parzialmente supportati - i dati verranno importati, ma grafici e analisi no.
  • Per importare un file .pzfx con grafici e analisi intatti, salvalo nuovamente come file .prism in GraphPad Prism prima di importarlo.

Come importare

  1. Nella scheda Data, clicca su Carica set di dati e seleziona il tuo file .prism.
  2. Appariranno tutti i set di dati del file - seleziona tutti o scegli quelli specifici.
  3. L'opzione per importare grafici e analisi è attivata di default. Se vuoi solo i dati grezzi, deseleziona questa opzione.
  4. Clicca su Import.

Per maggiori informazioni sull'importazione dei tuoi file .prism, consulta questo articolo.


Aggiungere grafici a un'illustrazione

Puoi usare i file BioRender Graphing direttamente nei tuoi file di illustrazione BioRender.

  1. Dall'editor di illustrazioni - Usa il pannello di inserimento grafici all'interno dell'editor per sfogliare e inserire grafici dai tuoi file BioRender Graphing. Una volta sulla tela, clicca sui singoli elementi del grafico per personalizzarli inline.
  2. Dalla Vista Graph Grid - Seleziona uno o più grafici e usa Aggiungi a illustrazione per inserirli in un file di illustrazione esistente. Una finestra modale ti permetterà di scegliere a quale file inviarli.

Nota: Quando selezioni un file dalla tua Galleria, cerca l'icona verde del grafico per identificare i file BioRender Graphing. I file Grafico (Classico) avranno un'icona grigia.

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