Créer des cartes thermiques et des cartes thermiques de plaques à puits dans BioRender Graphing

Si vous travaillez avec des données qui capturent des motifs, des intensités ou des variations à travers une structure en grille – comme des relevés de température, des niveaux d'expression génique ou des tests sur plaques à puits – une carte thermique peut être un excellent moyen de visualiser vos données. Les cartes thermiques de plaques à puits et les cartes thermiques vous permettent d’identifier rapidement les tendances et les valeurs aberrantes en utilisant la couleur pour représenter les valeurs, ce qui facilite l’interprétation et la communication de vos résultats. Voici comment vous pouvez en créer une dans BioRender Graph.

Guide étape par étape

Étape 1 : Ajoutez vos données dans BioRender Graph

L’importation intelligente de données organisera vos données pour vous.

• Chaque valeur du jeu de données correspond à la même position sur la carte thermique (par exemple, ligne 1, colonne 1 se trouve en haut à gauche).
• Vous pouvez coller vos propres données directement dans le jeu de données.

Étape 2 : Sélectionnez Carte thermique ou Carte thermique de plaque à puits et choisissez vos variables

Cliquez sur « Créer nouveau ». Lorsque vous ouvrez le menu Graphique, vous verrez deux options de cartes thermiques : cartes thermiques classiques et cartes thermiques de plaques à puits.

• Cartes thermiques classiques : polyvalentes et peuvent être utilisées pour une variété de jeux de données.
• Cartes thermiques de plaques à puits : spécialement conçues pour les données provenant de plaques à puits, chaque cellule représentant une ligne et une colonne de la plaque.

Étape 3 : Ajoutez vos variables

Spécifiez les variables pour Facteur Ligne, Facteur Colonne et Valeurs. Facteur Ligne et Facteur Colonne doivent être définis sur les variables contenant vos identifiants de ligne et de colonne. Cliquez sur « Continuer ».

Étape 4 : Personnalisez votre carte thermique ou votre carte thermique de plaque à puits

Vous pouvez personnaliser de nombreux éléments de la carte thermique, comme pour les autres visualisations BioRender Graph, y compris la police, le titre du graphique et les étiquettes des axes.

Personnalisez votre axe indépendant

Personnalisez votre axe dépendant

Personnalisez votre légende

Personnalisez le titre de votre graphique

Personnalisez vos données d’échantillon

Pour les cartes thermiques et les cartes thermiques de plaques à puits :

• Normalisation des données : appliquez une échelle par ligne ou colonne. Effectue une standardisation par score Z par ligne ou colonne. Les étiquettes des valeurs, les couleurs des éléments et la barre de couleur s’ajusteront automatiquement pour refléter les modifications.

• Personnalisation de la barre de couleur : cliquez sur la barre de couleur pour ouvrir le menu de personnalisation, où vous pouvez changer sa position sur le graphique et ajuster la bordure et l’arrière-plan.

Pour les cartes thermiques uniquement :

• Forme de la carte thermique : la forme par défaut est carrée, mais vous pouvez ajuster le rayon des coins en cliquant sur Rayon des coins et en augmentant la courbure.
• Espacement et marge : vous pouvez ajuster l’espacement entre les cellules et la marge entre les étiquettes de ligne/colonne et les cellules. Mettre l’espacement à 0 supprime les espaces entre les points de données, tandis que la marge ajoute un espace supplémentaire.

Pour les cartes thermiques de plaques à puits uniquement :

• Bordure de la plaque à puits : les coins arrondis sont la valeur par défaut, mais vous pouvez ajuster les paramètres de bordure en cliquant n’importe où sur la carte thermique.

• Personnalisation de l’affichage des puits : ajustez l’écart entre les puits, la largeur de la bordure et la couleur de la bordure pour adapter votre visualisation.

• Marge et remplissage : la marge ajuste l’écart entre les étiquettes de ligne/colonne et la plaque, tandis que le remplissage affecte l’espace entre les puits et le bord de la plaque.

Conseils de dépannage

Des puits vides dans votre carte thermique de plaque à puits ?

Si vous souhaitez afficher des puits vides en plus de vos données, assurez-vous d’entrer les noms de lignes et de colonnes pour ces puits. Si les étiquettes sont laissées vides, la carte thermique peut apparaître incomplète.

Besoin d’options de regroupement ou d’analyse ?

Nous travaillons activement sur ces fonctionnalités – restez à l’écoute !

Changer de type de carte thermique ?

Vous pouvez passer des cartes thermiques classiques aux cartes thermiques de plaques à puits via le menu déroulant. Gardez à l’esprit que toutes les personnalisations ne seront pas conservées, vous devrez donc peut-être ajuster certains paramètres après le changement. Nous recommandons de dupliquer votre graphique avant d’essayer un autre type de visualisation.